您好，关于您提出的小区里半夜3点多清理垃圾是否违法的问题，这主要涉及到噪音污染和垃圾清运时间的规定。

首先，从噪音污染的角度来看，根据我国《噪音污染防治法》的相关规定，夜间（通常指晚上十点至早晨六点）进行产生噪音的作业，如果噪音超过一定标准，确实可能构成违法行为。垃圾清运车在清运过程中产生的噪音，如果超出了当地规定的噪音标准，并且是在夜间进行的，那么这种行为就有可能被视为违法。

然而，垃圾清运的时间安排也受到多种因素的影响。一方面，为了确保垃圾能够及时清运，避免垃圾积存和产生异味，垃圾清运车通常需要在较短的时间内完成较大范围的清运工作。另一方面，为了避免在交通高峰时段进行清运，减轻交通拥堵压力，垃圾清运车可能会选择在夜间或清晨进行作业。

在实际操作中，不同地区对于垃圾清运的时间安排可能有所不同。有些地方可能会规定垃圾清运车在凌晨某个时间段之后不再进行作业，以减少对居民休息的影响。而有些地方则可能根据当地的实际情况和垃圾产生量，灵活调整垃圾清运的时间。

针对您所在小区半夜3点多清理垃圾的情况，我建议您首先了解当地对于垃圾清运时间的具体规定。如果当地规定夜间不得进行垃圾清运作业，或者垃圾清运车产生的噪音超出了当地规定的标准，那么您可以向相关部门（如城市管理局、环保局等）进行投诉和反映。

同时，您也可以与小区物业或社区进行沟通，了解他们对于垃圾清运时间的安排和考虑，看是否能够通过调整清运时间或采取其他措施来减少对居民的影响。

总之，小区里半夜3点多清理垃圾是否违法，需要结合当地的具体规定和实际情况来判断。如果您认为这种行为已经影响到了您的正常生活，建议您及时向相关部门进行投诉和反映，以维护自己的合法权益。