如果起诉离婚后双方复合，但对方没有撤诉，案件会继续按照法律程序推进，但你们可以通过以下方式处理以避免不必要的法律后果：

1. 主动向法院申请撤诉
   根据《民事诉讼法》第148条，原告在宣判前有权申请撤诉。即使对方未撤诉，你作为原告（或双方共同作为原告）可主动向法院提交书面撤诉申请，说明双方已和好并请求终止诉讼。法院审查后会裁定是否准许，通常只要撤诉出于自愿且不损害公共利益，法院会准许。

2. 若未及时撤诉，法院可能缺席判决或按原程序审理
   若双方均未撤诉且未出庭，法院可能视为“视为撤诉”（需满足《民事诉讼法》第146条条件，如经传票传唤无正当理由拒不到庭）或按原程序审理。若案件已进入实体审理阶段（如已开庭辩论），法院可能根据现有证据判决离婚或驳回诉求。但若双方已和好，判决离婚的可能性较低，但可能浪费司法资源并留下诉讼记录。

3. 复合后建议同步处理财产、子女等协议
   即使撤诉成功，若之前已提交财产分割、子女抚养等协议，建议双方重新签订书面协议（如《夫妻和好协议》），明确撤销原诉讼中的诉求或调整相关条款，避免未来因协议内容产生争议。

行动建议：

• 立即联系承办法官或书记员，说明复合情况并提交撤诉申请（需双方签字确认）；
  
• 若对方拒绝配合，可单独提交撤诉申请并附上复合证据（如和解协议、共同生活证明等）；
  
• 撤诉后，建议通过公证或律师见证方式固定复合事实，降低后续风险。
  

如有其他细节需进一步分析（如案件阶段、对方态度等），可直接向我咨询。