针对您提出的“交通违法被扣分，只有行驶证怎么交罚款”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，需要明确的是，仅持有行驶证是无法直接完成罚款缴纳的。因为交通违法处理通常需要同时核实驾驶人的身份信息和违法事实，而行驶证主要记录的是车辆信息，无法直接关联到驾驶人。因此，在处理交通违法时，除了行驶证外，您还需要提供有效的驾驶证件。
接下来，我为您梳理一下处理交通违法并缴纳罚款的一般流程：
核实违法信息：
- 您可以通过当地交警部门的官方网站、交通安全综合服务管理平台或相关手机APP，输入车牌号和车辆识别代码（VIN）来查询具体的违法信息。
- 或者，您也可以携带身份证、驾驶证和行驶证到交警大队的违法处理窗口，打印详细的违法记录清单进行核对。
准备必要证件：
- 在确认违法信息无误后，您需要准备好有效的驾驶证和行驶证，以便在处理违法时提供。
选择处理方式：
- 线上处理：如果违法情节较轻，且符合线上处理条件（如罚款金额在一定范围内、无争议等），您可以通过交通安全综合服务管理平台或相关手机APP进行在线处理，并缴纳罚款。
- 线下处理：如果违法情节较重，或者您选择线下处理，那么您需要携带驾驶证、行驶证和违法记录清单到交警大队的违法处理窗口进行办理。工作人员会核实您的违法信息，并告知您具体的罚款金额和缴纳方式。
缴纳罚款：
- 根据工作人员的指示，您可以选择合适的缴纳方式（如银行转账、支付宝、微信支付等）完成罚款的缴纳。
关注记分情况：
- 在处理完违法并缴纳罚款后，您需要关注自己的驾驶证记分情况。如果在一个记分周期内累计记分达到或超过12分，那么您需要按照相关规定参加学习和考试，以清除记分并恢复驾驶资格。
特别提醒：
- 如果您在处理违法时发现只有行驶证而缺少驾驶证，那么您需要尽快补办驾驶证或提供其他有效身份证明（如身份证、临时驾驶证等）以便完成处理。
- 为了避免类似情况再次发生，建议您在驾驶时严格遵守交通规则，提高安全意识，减少违法行为的产生。
最后，如果您对处理结果有任何疑问或不满，或者认为处罚决定有误或不公，您可以向当地交通管理部门提出行政复议或申诉，并提供充分证据和理由支持您的观点。希望以上解答能够对您有所帮助。