您好，关于您提出的“有了结婚证给小孩上户口还要亲子鉴定是否合法”的问题，我可以为您详细解答。
首先，要明确的是，在正常情况下，如果父母已经领取了结婚证，并且孩子的出生医学证明等文件齐全且信息准确，那么给孩子上户口一般是不需要亲子鉴定的。您只需要携带《出生医学证明》、父母一方的居民户口簿以及结婚证，向父亲或者母亲户口所在地公安派出所申报出生登记即可。
然而，也存在一些特殊情况，这些情况下可能需要提供亲子鉴定证明。具体来说，这些情况包括但不限于：
非婚生子女随父亲申报出生登记：如果父母没有领取结婚证，而孩子需要随父亲落户，那么就需要提供具有资质的鉴定机构出具的亲子鉴定证明，以证明父子关系。
出生证明信息有误：如果出生医学证明上的父母信息有误，或者孩子被拐卖后找回，需要确认血缘关系时，也可能需要进行亲子鉴定。
领养或再婚家庭：在领养或再婚家庭中，如果继父或继母需要给孩子落户，有时也需要证明孩子和亲生父母的关系，这时也可能需要进行亲子鉴定。
亲子鉴定的目的主要是为了防止拐卖、避免家庭纠纷以及堵住一些利用假证明进行落户的漏洞。虽然亲子鉴定可能会增加一些手续和费用，但它也是为了保护孩子和家庭的权益。
如果您在给孩子上户口的过程中被要求进行亲子鉴定，并且您认为这种情况并不符合上述特殊情况，那么您可以向派出所咨询具体原因，并要求他们提供相关的政策依据。同时，如果您确实需要进行亲子鉴定，一定要选择具有司法资质的正规鉴定机构进行，以确保鉴定结果的准确性和有效性。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或疑虑，欢迎随时向我提问。