结论前置：在起诉“小三”时，若发现其使用的手机号是用他人身份信息登记的，这并不影响你通过法律途径维护自身权益，但需要采取一些策略来确保诉讼的顺利进行。以下是一些具体的建议：

1. 收集其他证据：

   • 手机号虽为他人登记，但并非唯一证据。你可以收集其他与“小三”相关的证据，如聊天记录、转账记录、照片、视频、证人证言等，这些证据在证明“小三”身份及侵权行为方面可能更为直接和有力。
   • 特别注意收集能够证明“小三”与你的配偶存在不正当关系的证据，这是起诉“小三”侵犯配偶权或名誉权等的关键。

2. 申请法院调查取证：

   • 如果你无法直接获取“小三”的真实身份信息，可以向法院申请调查取证。法院有权要求相关机构（如通信运营商）提供手机号登记的实际使用人信息。
   • 在申请时，你需要提供足够的线索和理由，以说服法院认为调查取证是必要且可行的。

3. 利用已知信息起诉：

   • 如果“小三”的其他信息（如姓名、住址、工作单位等）已知，你可以直接以这些信息作为被告的身份信息进行起诉。
   • 在起诉状中，你可以详细描述“小三”的侵权行为及造成的损害，并附上相关证据。

4. 考虑起诉配偶及“小三”共同侵权：

   • 如果“小三”与你的配偶共同实施了侵权行为（如共同破坏婚姻关系），你可以考虑将配偶及“小三”作为共同被告提起诉讼。
   • 在这种情况下，你需要收集能够证明两者共同侵权的证据，如共同出行的记录、共同消费的凭证等。

5. 寻求专业法律帮助：

   • 起诉“小三”涉及复杂的法律程序和证据收集工作，建议你寻求专业律师的帮助。
   • 律师可以为你提供法律咨询、起草起诉状、代理诉讼等全方位的法律服务，确保你的权益得到最大程度的维护。

额外提醒：在起诉过程中，你需要保持冷静和理性，避免采取过激行为或言语攻击。法律是维护公平正义的工具，通过合法途径解决问题才是明智之举。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。