将扣押款中的旧版人民币替换为新版人民币，是否构成贪污行为，需根据具体情形来判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
若替换行为具有非法占有目的：
- 法律解释：贪污罪是指国家工作人员利用职务上的便利，侵吞、窃取、骗取或者以其他手段非法占有公共财物的行为。如果替换扣押款中的旧版人民币为新版人民币，是出于非法占有的目的，比如将替换下来的旧版人民币据为己有，或者利用替换行为掩盖其他贪污行为，那么这种行为就符合贪污罪的构成要件。
- 可能后果：一旦被认定为贪污行为，将面临刑事处罚，包括有期徒刑、拘役、罚金等，具体刑罚根据贪污数额和情节严重程度而定。
若替换行为出于合法目的且程序合规：
- 法律解释：如果替换扣押款中的旧版人民币为新版人民币，是出于合法目的，比如为了便于保管、管理或者按照相关规定进行兑换，且替换行为经过了合法程序，如经过相关部门批准、记录在案等，那么这种行为就不构成贪污。
- 可能后果：在这种情况下，替换行为是合法的，不会面临刑事处罚。但需要注意的是，即使出于合法目的，也必须确保替换行为的程序合规，否则可能因程序瑕疵而引发其他法律问题。
若替换行为涉及职务便利但无非法占有目的：
- 法律分析：有时候，替换行为可能涉及职务便利，但行为人并无非法占有的目的。例如，行为人可能认为旧版人民币的保管存在困难，或者出于其他合理考虑而进行了替换，但并未将替换下来的财物据为己有。在这种情况下，虽然行为可能涉及职务便利，但由于缺乏非法占有的目的，因此不构成贪污罪。然而，这种行为可能违反其他相关规定或职业道德规范，需要视具体情况而定。
- 建议：即使行为人无非法占有目的，也应谨慎处理涉及职务便利的行为，确保符合相关规定和职业道德规范。
法律建议：
- 对于涉及扣押款的管理和处置，应严格遵守相关法律法规和程序规定，确保行为的合法性和合规性。
- 如果因特殊原因需要替换扣押款中的旧版人民币为新版人民币，应事先经过相关部门批准，并记录在案，以确保行为的透明度和可追溯性。
- 如果对替换行为的合法性存在疑问或担忧，建议及时咨询专业律师或相关机构，以获取准确的法律意见和指导。
总结：替换扣押款中的旧版人民币是否构成贪污行为，取决于行为人的目的、行为程序以及是否涉及职务便利等多个因素。因此，在处理类似问题时，应谨慎分析具体情况，并咨询专业律师以获取准确的法律意见。如果你有进一步的法律问题或需要更详细的法律解释，可以直接向我咨询。