结论：公司要求自然日上班，周末是否算加班，这主要取决于公司的工作制度以及员工与公司的劳动合同或相关规章制度中的约定。
分析说明：
标准工时制下的情况：
- 在标准工时制下，员工每日工作时间不超过8小时，每周工作时间不超过40小时，且每周至少休息1日。若公司要求员工在周末（即通常的休息日）上班，且未安排补休，则根据《劳动法》的相关规定，这应被视为加班，公司需支付加班费。
- 加班费计算：若周末加班且未安排补休，加班费应不低于员工日工资的200%。具体计算公式为：加班费 = 日工资 × 200% × 加班天数。其中，日工资通常按照员工月工资除以月计薪天数（一般为21.75天）来计算。
综合计算工时制或不定时工时制下的情况：
- 若公司实行综合计算工时制或不定时工时制，且已依法获得劳动行政部门的批准，那么员工的工作时间可能不受标准工时制的限制。在这种情况下，周末上班是否算加班，需根据公司的具体规章制度以及劳动合同中的约定来确定。
- 如果公司规章制度或劳动合同中明确规定周末上班属于正常工作时间，且未违反法律法规的强制性规定，那么周末上班可能不被视为加班。但若公司规章制度或劳动合同中未明确规定，或规定与法律法规相冲突，则仍应按照法律法规的规定来处理。
公司规章制度与劳动合同的约定：
- 无论公司实行何种工时制，员工与公司的劳动合同以及公司的规章制度都是确定周末是否算加班的重要依据。如果劳动合同或规章制度中明确规定了周末上班的性质（如加班、调休等），则应按照约定来处理。
- 若劳动合同或规章制度中未明确规定，或规定模糊不清，员工有权要求公司进行明确解释，并在必要时寻求法律援助以维护自己的合法权益。
行动建议：
- 员工方面：若您对公司要求周末上班的性质有疑问，首先应查阅自己的劳动合同以及公司的规章制度，了解相关规定。若规定不明确或存在争议，建议与公司进行沟通协商，寻求明确答复。若协商无果，可向当地劳动行政部门投诉或寻求法律援助。
- 公司方面：为避免劳动纠纷，公司应明确制定并公示相关规章制度，明确周末上班的性质及加班费的支付标准。同时，在与员工签订劳动合同时，也应就相关问题进行明确约定，以保障双方的合法权益。
法律背景：
- 《劳动法》第三十六条规定：“国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。”（需注意，此处提及的44小时工时制已逐渐被40小时工时制所取代，但核心原则不变，即保障劳动者休息权）
- 《劳动法》第四十一条规定：“用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，一般每日不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。”
- 《劳动法》第四十四条规定：“有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：……（二）休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；……”
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