在货车超载发生交通事故后，保险公司是否拒赔以及损失由谁来承担，这是一个涉及法律规定、保险合同条款以及具体事故情形综合判断的问题。以下是对此问题的详细解答：
一、法律规定层面
交强险：
- 根据《机动车交通事故责任强制保险条例》，交强险的赔付不依赖于车辆是否存在超载等违法行为。只要是在交强险责任限额内，保险公司都应当对事故造成的本车人员、被保险人以外的受害人人身伤亡、财产损失进行赔付。
商业险：
- 《中华人民共和国保险法》规定，若保险标的（如车辆）的危险程度显著增加，被保险人应及时通知保险人。车辆超载会显著提高事故风险，若保险合同中明确将超载作为免责事由，且保险公司已尽到提示和明确说明义务，则保险公司可拒赔商业险范围内的损失。
二、保险合同条款层面
免责条款的效力：
- 商业车险合同中常设置免责条款，可能包括车辆超载。若保险公司能证明已就免责条款向投保人进行了提示和明确说明（如投保人签字确认），则条款有效，保险公司可拒赔。
- 若保险公司未尽到提示和明确说明义务，免责条款不产生效力，保险公司不能以超载为由拒赔。
超载与事故因果关系的判断：
- 若超载是事故的直接原因，且合同中有超载免赔条款，保险公司有权拒赔。
- 若超载并非事故直接原因（如因第三方车辆违规变道导致碰撞），则保险公司应承担赔偿责任。
共同承担责任与免赔率：
- 在某些情况下，即使超载不是事故直接原因，保险公司也可能与车主共同承担责任，并实行一定的绝对免赔率或采用较低的无过失免赔比例。
三、司法实践层面
- 法院在判决时会综合考虑保险公司是否尽到提示和明确说明义务、超载与事故的因果关系等因素。若保险公司能提供充分证据证明已尽到义务且超载是事故直接原因，则法院可能支持拒赔主张；反之，则可能判决保险公司承担赔偿责任。
四、损失承担建议
若保险公司拒赔且法院支持其主张：
- 损失将由货车车主或驾驶员承担。因此，货车司机应严格遵守交通法规，避免超载行为，以降低事故风险和理赔纠纷的可能性。
若保险公司需承担赔偿责任：
- 保险公司将在交强险和商业险（若合同有效且未触发免责条款）范围内对事故损失进行赔付。
争议解决方式：
- 在发生争议时，被保险人可以通过协商、仲裁或诉讼等方式解决与保险公司的赔偿问题。
总结：货车超载出险后，保险公司的赔偿决定需综合考虑法律规定、保险合同的具体约定以及事故的具体情形。投保人应充分了解合同条款，遵守交通法规，以维护自身权益并降低风险。在发生事故时，及时与保险公司沟通并寻求专业法律意见是明智之举。