在两车事故中，当主次责任已经明确后，赔偿问题确实是一个涉及多个法律知识点和实际操作步骤的复杂过程。以下是我为您整理的详细赔偿指南：

一、赔偿责任主体

首先，需要明确赔偿责任主体，这通常包括事故双方的驾驶员、车主以及各自的保险公司，特别是交强险和商业三者险的承保公司。

二、赔偿顺序

赔偿顺序是先由交强险在责任限额内进行赔付，超出部分再按照主次责任比例进行分担。如果车辆还投保了商业三者险，那么超出交强险责任限额的部分，将由商业三者险按照保险合同约定进行赔偿。若仍有不足，则由侵权人（即事故责任方）自行承担。

三、交强险赔付规则

交强险是法定强制保险，无论被保险人有无责任，均需在责任限额内赔偿。具体赔付限额如下：

• 有责赔偿限额：死亡伤残18万元，医疗费用1.8万元，财产损失2000元。
• 无责赔偿限额：死亡伤残1.8万元，医疗费用1800元，财产损失100元。

四、主次责任划分与赔偿比例

主次责任的划分是基于当事人在事故中的过错程度及其对事故发生的作用。具体赔偿比例可能因事故类型和具体情况而有所不同：

• 机动车与机动车之间：主责方通常承担70%-80%的赔偿责任，次责方承担20%-30%。
• 机动车与非机动车驾驶人、行人之间：机动车一方主责时，通常承担80%-90%的赔偿责任；非机动车驾驶人、行人一方主责时，机动车一方承担20%-40%的赔偿责任。

五、赔偿项目

赔偿项目主要包括人身损害赔偿和财产损失赔偿：

• 人身损害赔偿：包括医疗费、误工费、护理费、交通费、住宿费、住院伙食补助费、必要的营养费等。如果造成残疾或死亡，还需赔偿相应的残疾赔偿金、死亡赔偿金等费用。
• 财产损失赔偿：包括车辆维修费、重置费、车载物品损失、施救费用等。如果是营运车辆，还需赔偿停运损失。

六、实际操作建议

1. 及时联系专业律师或相关机构：了解自己的权利和义务，以便在赔偿过程中做出明智的决策。
2. 保留好所有相关证据材料：如事故现场照片、医疗记录、费用清单等，这些证据将在赔偿协商或诉讼中起到关键作用。
3. 合理进行赔偿协商：在协商过程中，保持冷静和理性，尽量达成双方都能接受的赔偿协议。
4. 必要时通过诉讼程序维护权益：如果协商不成，可以选择向法院提起诉讼，通过法律途径来维护自己的合法权益。

七、举例说明

假设甲、乙两车发生碰撞，甲车负主要责任，乙车负次要责任。甲车投保了交强险和100万商业三者险，乙车只投保了交强险。事故造成乙车维修费5000元，驾驶员医疗费30000元，误工费10000元。那么：

• 甲车交强险将赔偿乙车财产损失2000元，医疗费用18000元，误工费10000元，共计30000元。
• 剩余损失15000元（车辆维修费3000元+医疗费12000元），将按照70%和30%的责任比例进行划分。甲车商业三者险将赔偿10500元（15000元×70%），乙车需自行承担4500元（15000元×30%）。

综上所述，两车事故中的主次责任赔偿问题需要综合考虑多个方面，包括赔偿责任主体、赔偿顺序、交强险赔付规则、主次责任划分与赔偿比例、赔偿项目以及实际操作建议等。在实际操作中，建议您寻求专业法律帮助，以确保自身权益得到充分保障。