针对您提出的“三级公路占用水田怎么赔偿”的问题，这并非一个全国统一的标准，而是会受到多种因素的影响，并由各地政府根据实际情况来制定具体的补偿方案。不过，我可以为您详细阐述在确定这类补偿时通常会遵循的原则、依据以及大致的补偿项目和标准。

首先，补偿项目通常包括土地补偿费、安置补助费以及地上附着物和青苗的补偿费。

1. 土地补偿费：这是对土地所有者因土地被征收而造成的经济损失进行的补偿。一般来说，补偿标准会是该耕地被征收前三年平均年产值的六至十倍，但具体数额会根据地区的经济发展水平、土地资源稀缺程度等因素有所差异。

2. 安置补助费：这是用于安置因土地征收而失去土地的农业人口的生活费用。补助费的标准会按需要安置的农业人口数来计算，每个需要安置的农业人口的安置补助费为该耕地被征收前三年平均年产值的四至六倍。同时，每公顷被征收耕地的安置补助费最高不得超过被征收前三年平均年产值的十五倍。

3. 地上附着物和青苗的补偿费：这是对被征收土地上的各种建筑物、构筑物及其他设施以及尚不能收获的农作物进行的补偿。具体补偿金额会根据地上附着物的类型和青苗的种类、产值等因素来确定，并由省、自治区、直辖市进行规定。

在制定补偿标准时，主要会依据《中华人民共和国土地管理法》等相关法律法规，确保征收土地给予公平、合理的补偿。同时，还会遵循公平合理原则和保障生活水平原则，确保被征地农民得到合理的经济补偿，并保障其原有生活水平不降低，长远生计有保障。

此外，影响赔偿金额的其他因素还包括土地所在地区、土地类型、土地使用权情况、占地面积以及公路建设对当地经济和环境的影响等。这些因素都会在不同程度上影响最终的补偿标准。

针对您的具体情况，我建议您：

1. 密切关注当地政府发布的征地补偿安置方案公告，了解具体的补偿标准和政策。
2. 咨询当地的自然资源部门、农业农村部门等相关政府机构，以获取准确的补偿标准信息和相关政策解读。
3. 如有必要，可咨询当地律师或法律专家，了解具体的法律规定和赔偿标准，并寻求专业的法律帮助来维护自己的合法权益。
4. 如果对补偿标准有异议，可以通过合法途径申请听证、行政复议或提起行政诉讼来维护自身权益。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。