不能直接认定没有登记的房屋为不合法房屋。房屋的合法性并非仅由是否登记这一单一因素决定，而是需要综合考虑多个方面。以下从不同角度进行分析：

1. 登记与房屋合法性的关系：

   • 房屋登记是物权公示的一种方式，它有助于确认房屋的权属状态，保护交易安全。然而，未登记并不意味着房屋本身不合法。例如，在一些农村地区，由于历史原因或登记制度的不完善，许多房屋可能并未进行登记，但这并不影响其作为合法财产的存在。

2. 合法房屋的认定标准：

   • 合法房屋通常指的是符合城市规划、建筑规范、土地使用规定等法律法规要求，并经过相关部门审批或备案的房屋。这些房屋在建造过程中遵循了相关法律法规，因此被视为合法。
   • 即使房屋未进行登记，只要其建造过程符合法律法规要求，且没有违反相关强制性规定，那么该房屋仍然可以被视为合法房屋。

3. 未登记房屋可能面临的法律问题：

   • 虽然未登记房屋本身不一定不合法，但未登记可能会影响房屋的权属确认、交易、继承等法律行为的效力。例如，在房屋买卖过程中，未登记的房屋可能无法顺利办理过户手续，从而影响交易的完成。
   • 此外，如果房屋存在权属纠纷或违法建造等情况，即使进行了登记，也可能面临被认定为不合法房屋的风险。

4. 特殊情况下的房屋登记与合法性：

   • 在某些特殊情况下，如历史遗留问题、政策性住房等，房屋可能因各种原因未进行登记。对于这些房屋，需要根据具体情况进行判断和处理。例如，对于历史遗留问题房屋，政府可能会出台相关政策进行确权登记或补办手续；对于政策性住房，则需要根据相关政策规定来确定其合法性。

建议：

• 如果您拥有一套未登记的房屋，并担心其合法性问题，建议您先了解该房屋的建造过程、审批手续等相关情况。
• 如果房屋建造过程符合法律法规要求，且没有违反相关强制性规定，那么您可以考虑向相关部门申请登记或补办手续，以确认房屋的权属状态。
• 如果房屋存在权属纠纷或违法建造等情况，建议您及时咨询专业律师，了解相关法律法规和政策规定，以便采取合适的法律措施维护自己的权益。

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