结论前置：夫妻共有财产被执行拍卖后，法院退还配偶份额的方式主要取决于财产的权属状况、执行依据以及配偶是否提出异议等因素，以下分情况说明：

1. 若财产明确为夫妻共同共有，且无其他特殊约定
   根据《民法典》第1062条，夫妻在婚姻关系存续期间所得的财产，除另有约定外，属于共同共有。若执行标的为夫妻共同财产（如婚后购买的房产、车辆等），法院拍卖后需先分割财产，仅执行被执行人（即夫妻一方）的份额。

   • 操作流程：配偶可在执行阶段向法院提出案外人异议，主张对财产的共有权，并要求分割拍卖款中属于自己的50%份额。法院审查属实后，会将对应款项退还配偶。
     
   • 例外情形：若夫妻双方约定财产归一方所有（如婚内财产协议），但未办理产权变更登记（如房产未过户），法院可能仍按共同财产处理，但配偶可凭协议主张权利。

2. 若财产登记在被执行人名下，但配偶主张为个人财产
   若配偶能证明财产系其个人财产（如婚前全款购买、继承或受赠明确归一方所有等），需在执行阶段提出执行异议之诉，并提供证据（如购房合同、付款凭证、遗嘱等）。法院确认财产权属后，会排除对配偶份额的执行，并退还全部拍卖款。

   • 风险提示：若配偶无法充分举证，法院可能认定财产为共同共有，仅退还50%份额。

3. 若配偶同意拍卖但要求保留必要生活费用
   根据《民事诉讼法》第243条，被执行人及其所扶养家属的生活必需费用，法院应保留。若配偶无其他住所或生活来源，可向法院申请从拍卖款中预留必要费用（如租房费用、基本生活费等）。

   • 操作建议：配偶需提交生活困难证明（如居委会证明、无房证明等），法院会结合实际情况裁定预留金额。

4. 若拍卖款不足以清偿全部债务
   若拍卖所得扣除执行费用后仍不足以清偿被执行人的债务，法院不会退还配偶份额，而是将全部款项用于偿债。配偶的共有权仅体现在债务清偿后的剩余价值分配上（若有剩余）。

温馨提示：若您的夫妻共有财产已被执行拍卖，建议尽快携带财产权属证明（如结婚证、房产证、财产协议等）向执行法院提出书面异议，避免权益受损。如有复杂情况（如财产涉及第三人权益、多次查封等），可进一步向我咨询具体应对方案。