结论前置：网贷公司起诉后，如果贷款已经还清，网贷公司通常会选择撤诉，但并非绝对，具体还需视情况而定。
一、一般情况分析
- 诉讼目的实现：从法律程序的角度来看，网贷公司起诉的主要目的是追讨欠款。当借款人及时还清了欠款，网贷公司的核心诉求已经得到满足，继续进行诉讼已无实际意义。因此，在大多数情况下，网贷公司会向法院提交撤诉申请，以终止诉讼程序。
- 法院审查与准许：法院在收到网贷公司的撤诉申请后，会进行审查。如果审查认为撤诉申请符合相关规定，法院会准许撤诉，从而正式结束诉讼。
二、特殊情况考量
尽管在大多数情况下，还清欠款会导致撤诉，但也存在一些特殊情况，即使欠款已经还清，网贷公司也可能不选择撤诉：
- 存在其他争议：如果双方对于逾期利息、违约金的计算方式，或者在借贷合同中关于其他条款的执行存在分歧，即便本金和基本利息已经偿还，网贷公司仍可能希望通过诉讼来明确这些问题，以维护自身利益。
- 诉讼成本考量：网贷公司在起诉过程中已经投入了一定的人力、物力和财力等诉讼成本。如果这些成本无法通过撤诉得到弥补，或者网贷公司认为继续推进诉讼程序能够争取到更多的利益（如让借款人承担部分诉讼费用等成本），那么网贷公司可能会选择继续诉讼。
- 法院裁决需要：即使借款人已经还清了款项，但如果法院认为借款人的行为已经构成违约，并需要对其进行法律制裁（如支付违约金或承担其他法律责任），那么案件可能仍会继续进行。
三、建议与对策
- 积极沟通协商：面临网贷逾期被起诉的情况时，借款人应尽快与网贷公司协商还款事宜，并尽量达成一个双方都能接受的还款协议。这有助于减少不必要的法律纠纷和诉讼成本。
- 保留还款证据：在还清欠款后，借款人应妥善保留还款凭证和相关证据，以备不时之需。这些证据在后续可能出现的法律纠纷中将起到关键作用。
- 寻求法律援助：如果借款人对于法律程序或相关条款存在疑问，或者担心自己的权益受到侵害，可以寻求专业的法律援助。作为专注于婚姻家庭、经济纠纷领域的律师，我可以为你提供详细的法律咨询和帮助，以更好地应对可能出现的法律问题。
综上所述，网贷公司起诉后还清贷款虽然大概率会导致撤诉，但不能绝对保证。借款人应与网贷公司积极沟通协商，并保留好还款证据。如有需要，可以随时向我咨询相关法律问题。