结论：在自然人独资公司的仲裁案件中，能否保全老板（即公司唯一股东）的财产，需根据具体情况判断，主要取决于公司财产是否与股东个人财产混同，以及是否满足财产保全的法定条件。以下从不同角度详细分析：

1. 公司财产与股东个人财产混同的情况

• 法律依据：根据《公司法》第六十三条，一人有限责任公司的股东不能证明公司财产独立于股东自己的财产的，应当对公司债务承担连带责任。这意味着，如果股东无法证明公司财产与个人财产独立，仲裁机构或法院可以认定股东需对公司债务承担连带责任，从而可能保全股东的个人财产。
• 实践操作：在仲裁或诉讼中，若申请人能提供初步证据（如公司账户与股东账户资金往来频繁、公司财产被股东随意处置等）表明公司财产与股东个人财产混同，仲裁机构或法院可能会裁定保全股东的个人财产。

2. 公司财产与股东个人财产独立的情况

• 法律依据：若股东能证明公司财产独立于个人财产（如通过审计报告、财务制度等证明公司财产与股东财产严格分离），则股东无需对公司债务承担连带责任。此时，仲裁机构或法院通常不会保全股东的个人财产。
• 实践操作：股东需提供充分的证据（如年度财务审计报告、公司章程、财务制度等）证明公司财产独立。若证据充分，仲裁机构或法院将驳回保全股东个人财产的申请。

3. 财产保全的法定条件

• 必要性：根据《仲裁法》第二十八条，当事人申请财产保全需满足“因一方当事人的行为或者其他原因，可能使裁决不能执行或者难以执行”的条件。即，申请人需证明存在财产被转移、隐匿或毁损的风险。
• 担保要求：申请人通常需提供担保（如银行保函、财产抵押等），以确保因保全错误给被申请人造成损失时，能够予以赔偿。

4. 实务建议

• 申请人角度：若认为公司财产与股东个人财产混同，建议在申请仲裁时一并申请财产保全，并提供初步证据（如银行流水、财务记录等）支持混同主张。
• 股东角度：若公司财产独立，应提前准备审计报告、财务制度等证据，以应对可能的保全申请。同时，可主动向仲裁机构或法院提交证据，证明财产独立，避免不必要的保全。

5. 风险提示

• 保全错误风险：若保全申请被驳回或保全错误，申请人可能需承担赔偿责任。因此，申请前应充分评估证据充分性和保全必要性。
• 执行风险：即使保全成功，若最终裁决无法执行（如公司无财产可供执行），股东个人财产仍可能被执行（仅限于混同情况下）。

总结：自然人独资公司仲裁中能否保全老板财产，关键在于公司财产与股东个人财产是否混同，以及是否满足财产保全的法定条件。建议根据具体情况准备证据，并咨询专业律师以制定策略。如有进一步问题，可直接向我咨询。