亲子鉴定在技术上可以由一方申请对两个人的样本进行鉴定，但需注意法律程序和伦理要求。以下是具体分析：

1. 技术可行性
   亲子鉴定通过比对DNA样本的遗传标记（如STR位点）确定亲子关系，技术上只需采集被鉴定人（如父母与子女）的生物样本（血液、口腔拭子等），即可完成鉴定。因此，一方申请对两个人的样本进行鉴定在技术上是完全可行的。例如，父亲可单独委托鉴定机构对子女与自己的样本进行比对。

2. 法律程序要求

   • 自愿原则：根据《民法典》第1073条，亲子关系确认需以“自愿”为前提。若被鉴定人（如子女）为未成年人，需由其法定代理人（如父母一方）同意；若被鉴定人已成年，则需其本人书面同意。
     
   • 鉴定机构资质：需选择具有司法鉴定许可证的正规机构，确保鉴定报告的法律效力。若用于诉讼，法院可能要求重新鉴定或指定机构。
     
   • 隐私保护：鉴定机构有义务对样本来源和鉴定结果保密，但申请人需避免通过非法手段获取样本（如偷取他人毛发），否则可能涉嫌侵犯隐私权。

3. 伦理与实际限制

   • 家庭关系影响：若一方未经另一方同意擅自鉴定，可能引发家庭矛盾。例如，母亲单独带子女鉴定，若结果否定亲子关系，可能对子女心理造成伤害。
     
   • 样本真实性风险：若被鉴定人拒绝配合，申请人可能伪造样本（如用他人样本冒充），导致鉴定结果无效。此时，鉴定机构有权拒绝受理或要求重新采样。
     
   • 用途限制：若鉴定用于上户口、移民等，需提供关系证明（如出生证），单方申请可能因材料不全被拒。

建议：若需进行亲子鉴定，建议先与被鉴定人沟通，取得其同意后共同委托正规机构。若涉及法律纠纷（如离婚、继承），可提前咨询律师，确保程序合法、证据有效。如有进一步疑问，可直接向我提问。