询证函手续费一般由发出询证函的一方承担，但具体承担方需根据实际情况和双方约定来确定。以下从不同角度进行分析：

1. 常规商业实践角度：

   • 在商业活动中，询证函通常由一方（如审计机构、银行或企业）为了核实账户信息、交易情况等而发出。按照常规商业实践，发出询证函的一方会承担相关的手续费，因为这是其为了获取必要信息而进行的主动行为。

2. 合同约定角度：

   • 如果双方在合同中明确约定了询证函手续费的承担方，那么应按照合同约定来执行。合同是双方意思自治的体现，具有法律约束力，因此合同中的约定应被优先遵循。

3. 特殊情况角度：

   • 在某些特殊情况下，如双方存在长期合作关系、一方对另一方有特殊要求或依赖等，询证函手续费的承担方可能会通过协商来确定。这种情况下，双方应根据实际情况和公平原则来协商确定手续费的承担方。