结论：在公司上班六年因体检未通过是否会被辞退，不能一概而论，需根据体检未通过的具体原因、公司规章制度以及相关法律法规来综合判断。以下从不同角度进行分析：
体检未通过的原因与岗位需求的关系
- 若体检未通过的原因与岗位需求直接相关：例如，岗位对视力、听力、体力等有特定要求，而员工体检未达标，且无法通过调整岗位或提供合理便利来满足工作需求，那么公司可能会依据《劳动合同法》的相关规定，以员工不能胜任工作为由，经过培训或调整工作岗位后仍不能胜任的，提前三十日以书面形式通知员工本人或额外支付员工一个月工资后，解除劳动合同。但在此过程中，公司需确保解除劳动合同的程序合法，且已尽到合理的调整岗位或培训义务。
- 若体检未通过的原因与岗位需求无直接关联：例如，员工患有某种慢性疾病，但该疾病并不影响其正常履行岗位职责，那么公司无权仅凭体检结果就辞退员工。此时，公司若强行辞退，可能构成违法解除劳动合同，需承担相应的法律责任。
公司规章制度的规定
- 公司规章制度中若明确规定了体检未通过的处理方式，且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司可能会依据规章制度来处理。但即便如此，公司在执行规章制度时，也需确保程序的合法性和合理性，避免侵犯员工的合法权益。
- 若公司规章制度中未明确规定体检未通过的处理方式，或规定的内容违反法律法规的强制性规定，那么公司不能仅凭规章制度就辞退员工。
相关法律法规的适用
- 根据《劳动合同法》的相关规定，公司解除劳动合同需符合法定条件，且需遵循法定程序。若公司仅凭体检未通过就辞退员工，且无法证明该员工不能胜任工作或存在其他法定解除劳动合同的情形，那么公司的行为可能构成违法解除劳动合同。
- 此外，若员工因体检未通过而遭受歧视或不当对待，员工还可以依据《劳动法》、《就业促进法》等相关法律法规来维护自己的合法权益。
建议：
- 对于员工而言，若因体检未通过而面临被辞退的风险，首先应了解体检未通过的具体原因以及该原因与岗位需求的关系。同时，仔细审查公司规章制度中关于体检未通过的处理方式，确保自己的权益不受侵犯。若认为公司的行为违法或不合理，可以及时向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
- 对于公司而言，在处理体检未通过的员工时，应确保程序的合法性和合理性，避免侵犯员工的合法权益。同时，公司也可以考虑为员工提供必要的帮助和支持，如调整岗位、提供培训等，以帮助员工更好地适应工作需求。
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