当劳动者违反竞业限制协议，且协议中未明确约定赔偿金额时，其赔偿责任及金额的确定主要依据法律规定和实际情况来综合考量。以下是对此问题的详细解答：
一、赔偿责任
劳动者违反竞业限制协议时，其赔偿责任主要包括两个方面：
支付违约金（若协议中有约定）：
- 尽管您提到协议中未约定金额，但通常竞业限制协议会包含违约金的条款。若确实未约定，则此部分不适用。不过，若协议中有其他相关表述或可推断出违约金的存在及计算方式（如提及“按一定比例支付违约金”等），则可能据此执行。但在此情境下，我们主要讨论未约定金额的情况。
赔偿实际损失：
- 当协议中未约定违约金或违约金数额不合理时，劳动者需赔偿用人单位因其违约行为所遭受的实际损失。这包括用人单位因劳动者违约而失去的商业机会、客户流失、市场份额下降等所导致的直接经济损失，以及为调查和制止违约行为而支付的合理费用。
二、赔偿金额的确定
在确定赔偿金额时，法院或仲裁机构会综合考虑以下因素：
劳动者的收入水平：
- 劳动者的收入越高，其违约行为可能对用人单位造成的损失也越大，因此赔偿金额可能会相应提高。
用人单位的损失情况：
- 用人单位需要提供充分的证据证明其因劳动者违约所遭受的实际损失。这可能包括财务报表、客户流失记录、市场份额变化等。法院或仲裁机构将根据这些证据来确定赔偿金额。
劳动者的过错程度：
- 如果劳动者故意违反竞业限制协议，其过错程度较高，赔偿金额可能会相应增加。相反，如果劳动者是因疏忽或误解而违反协议，其过错程度较低，赔偿金额可能会相应减少。
三、特殊情况下的处理
继续履行竞业限制义务：
- 在某些情况下，用人单位可能要求劳动者继续履行竞业限制义务，而不是仅仅要求其支付赔偿金。这意味着劳动者需要停止其违反竞业限制的行为，并在剩余的竞业限制期限内遵守相关约定。
协议的合法性与有效性：
- 竞业限制协议必须符合法律规定，否则可能被认定为无效。例如，协议不得剥夺劳动者的基本就业权利，且补偿金的标准应合理。如果协议存在违法或不合理之处，法院或仲裁机构可能会对赔偿金额进行调整或驳回用人单位的赔偿请求。
四、建议与注意事项
对于用人单位：
- 在与劳动者签订竞业限制协议时，应明确约定违约金的数额或计算方式，以及赔偿实际损失的范围和计算方法。
- 保留好与劳动者违约行为相关的证据，以便在追究违约责任时提供充分的支持。
- 及时采取法律措施维护自身权益，避免损失扩大。
对于劳动者：
- 在签订竞业限制协议前，应仔细阅读协议条款，了解自己的权利和义务。
- 如果对协议内容有疑问或不满，应及时与用人单位沟通协商，避免后续纠纷。
- 一旦违反竞业限制协议，应积极与用人单位协商解决，尽量减少损失和影响。
综上所述，当劳动者违反竞业限制协议且未约定赔偿金额时，其赔偿责任主要依据实际损失来确定。法院或仲裁机构将综合考虑劳动者的收入水平、用人单位的损失情况以及劳动者的过错程度等因素来确定赔偿金额。因此，建议用人单位和劳动者在签订竞业限制协议时明确约定相关条款，以避免后续纠纷和损失。