电子协议和劳动合同可以并存。以下从不同角度对此问题进行分析：

一、法律层面

1. 电子协议的法律效力：根据《中华人民共和国电子签名法》的相关规定，民事活动中的合同或者其他文件、单证等文书，当事人可以约定使用电子签名、数据电文。只要电子协议符合法律规定的要件，即具有法律效力。这意味着，电子协议在法律上是被认可的，可以作为合同的一种形式存在。

2. 劳动合同的特殊性：劳动合同是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。虽然《中华人民共和国劳动合同法》并未明确规定劳动合同必须采用书面形式，但根据该法第十条的规定，建立劳动关系，应当订立书面劳动合同。这里的“书面”并未排除电子形式，只要电子劳动合同能够清晰地反映双方的权利和义务，且符合法律、行政法规的规定，就应当被视为有效的劳动合同。

3. 并存的可能性：既然电子协议具有法律效力，且劳动合同并未被排除在电子协议之外，那么电子协议和劳动合同在法律上是可以并存的。实际上，许多用人单位已经开始采用电子劳动合同的形式，以提高效率、降低成本。

二、实践层面

1. 电子劳动合同的便利性：电子劳动合同具有存储方便、查阅快捷、不易丢失等优点。对于用人单位和劳动者来说，使用电子劳动合同可以大大提高工作效率，减少纸质文件的管理成本。

2. 并存的形式：在实践中，电子协议和劳动合同并存的形式可能多种多样。例如，用人单位可以先与劳动者签订一份纸质的劳动合同，明确双方的基本权利和义务；然后，再通过电子协议的形式，对某些特定事项进行补充约定或修改。或者，用人单位和劳动者也可以直接签订一份电子劳动合同，将所有条款都包含在内。

3. 注意事项：虽然电子协议和劳动合同可以并存，但用人单位和劳动者在签订时仍需注意以下几点：

   • 确保电子协议的合法性和有效性，即符合《中华人民共和国电子签名法》等相关法律的规定；
   • 明确电子协议与纸质劳动合同之间的关系，避免产生歧义或冲突；
   • 妥善保存电子协议，以备不时之需。

三、风险防控

1. 证据保存：对于电子协议和劳动合同，用人单位和劳动者都应妥善保存相关证据，如电子数据的存储记录、传输记录等，以证明协议的真实性和有效性。

2. 法律合规：在签订电子协议和劳动合同时，用人单位和劳动者应确保协议内容符合法律、行政法规的规定，避免因违法条款而导致协议无效或产生法律纠纷。

3. 争议解决：在发生争议时，用人单位和劳动者应首先尝试通过协商、调解等方式解决；若协商、调解无果，则可以依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。

综上所述，电子协议和劳动合同在法律上是可以并存的。用人单位和劳动者在签订时，应确保协议的合法性和有效性，并妥善保存相关证据以备不时之需。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。