当机动车发生事故导致人员死亡，且车主承担50%责任时，关于保险公司的赔付问题，我们可以从以下几个方面进行详细解答：
一、赔偿项目与标准
在机动车撞死人的事故中，赔偿项目主要包括死亡赔偿金、丧葬费、被扶养人生活费（如适用）、精神损害抚慰金（如适用）以及其他合理费用。这些费用的计算都有明确的标准，例如死亡赔偿金是按照受诉法院所在地上一年度城镇居民人均可支配收入或者农村居民人均纯收入标准，按二十年计算（六十周岁以上的，年龄每增加一岁减少一年；七十五周岁以上的，按五年计算）。
二、保险赔偿限额与流程
交强险赔偿：
- 交强险是机动车必须购买的保险，其死亡伤残赔偿限额为18万元（自2023年起调整）。这部分赔偿是优先用于赔付死亡赔偿金、丧葬费等法定项目的。
商业三者险赔偿：
- 如果车主还购买了商业三者险，比如50万的保额，那么在交强险赔付后，剩余的部分将由商业险在保额范围内承担。以您提到的50%责任为例，如果总损失为100万元，交强险会先赔付18万元，然后商业险最高赔付50万元（因为保额是50万），剩余的32万元（如果车主没有其他保险或免赔情况）则需要车主自行承担。但在这个案例中，由于车主只承担50%责任，所以实际车主可能需要承担的金额会少于32万元，具体数额需要根据事故具体情况和保险条款来确定。
赔偿顺序：
- 赔偿的顺序是先由交强险全额赔付，不足部分再由商业险按比例承担，如果仍有不足，则由侵权人（即车主）补足。
三、车主责任与注意事项
超出保险限额的责任：
- 如果赔偿金额超过了保险总额，车主需要自行承担差额部分。因此，车主在购买保险时，应根据自己的经济状况和风险承受能力来选择合适的保额。
刑事责任风险：
- 如果交通肇事致人死亡且车主负主要以上责任，可能构成交通肇事罪，面临三年以下有期徒刑或拘役的刑事处罚。但如果车主积极赔偿并取得受害者家属的谅解，可以从轻处理。
理赔材料准备：
- 为了确保理赔流程的顺利，车主需要准备齐全的事故认定书、死亡证明、户籍证明、收入证明等材料。
综上所述，当机动车撞死人且车主承担50%责任时，保险公司会先通过交强险进行赔付，不足部分再由商业三者险在保额范围内承担。车主需要根据自己的保险情况和事故具体情况来了解可能承担的赔偿金额，并准备好相应的理赔材料。同时，车主也应注意到可能面临的刑事责任风险，并积极采取措施来减轻或避免这种风险。