当申请执行人（这里我们理解为原本的债权人，在执行程序中为申请执行的一方）破产时，其执行案件的处理将受到《中华人民共和国企业破产法》、《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释的严格调整。以下是对此问题的详细解答：
一、执行程序的中止与移交
执行程序的中止：
- 一旦申请执行人进入破产程序，虽然直接的法律效果通常首先体现在被执行人破产时执行程序的中止，但在此情境下，若申请执行人（债权人）的破产程序启动，且其作为执行程序中的一方，其财产状况和执行能力已发生根本性变化，执行法院通常会根据实际情况，包括破产管理人的申请或法院自身的审查，决定是否中止原执行程序。不过，更直接且常见的是，若被执行人同时或随后也进入破产程序，则执行程序必然中止。此处我们主要聚焦申请执行人破产对执行程序的影响逻辑，实际上在申请执行人破产时，若被执行人未破产，执行程序可能因申请执行人丧失执行能力而面临调整或终结，但若被执行人也破产，则执行程序必然因被执行人破产而中止。
- 法律依据：虽然直接针对申请执行人破产时执行程序中止的法条不常见，但《中华人民共和国企业破产法》第十九条关于被执行人破产时执行程序中止的规定，以及破产法整体对债权人、债务人财产状况变化的调整原则，为理解申请执行人破产时执行程序的调整提供了法律逻辑基础。同时，《中华人民共和国民事诉讼法》中关于执行中止的一般规定（如第二百五十六条）也可作为参考，即当一方当事人状况发生重大变化，影响执行程序继续进行时，可中止执行。
案件材料的移交：
- 若因申请执行人破产（且通常伴随被执行人破产或执行程序无法继续的实际情况）导致执行程序需要调整，执行法院可能会根据破产管理人的申请或法院自身的决定，将相关案件材料移送至受理破产案件的法院，以便在破产程序中统一处理债权债务关系。
二、破产程序中的债权申报与清偿
债权申报：
- 申请执行人破产时，其作为债权人，在破产程序中需向管理人申报债权。这包括其在执行程序中未实现的债权。
- 法律依据：《中华人民共和国企业破产法》第四十四条：“人民法院受理破产申请时对债务人享有债权的债权人，依照本法规定的程序行使权利。”
清偿顺序：
- 破产财产将按法定顺序清偿。首先用于清偿破产费用和共益债务，然后按以下顺序清偿：职工的工资、医疗、伤残补助、抚恤费用及基本养老保险、基本医疗保险费用；除前款外的社会保险费用和破产人所欠税款；普通破产债权。
- 法律依据：《中华人民共和国企业破产法》第一百一十三条。
三、破产程序终结后的执行问题
- 破产程序终结后，未清偿的债权一般不再清偿。但若发现有应追回的财产或破产人有其他可供分配的财产，债权人可请求法院按破产财产分配方案进行追加分配。
- 法律依据：《中华人民共和国企业破产法》第一百二十三条。
四、债权人的权益保护建议
- 密切关注破产程序进展：债权人应密切关注申请执行人（及被执行人，若其也破产）的破产程序进展，及时了解破产管理人的公告和通知。
- 及时申报债权：在破产程序中，债权人需及时向管理人申报债权，并提供相关证据材料，以确保其债权得到确认和清偿。
- 参与债权人会议：债权人应积极参与债权人会议，了解破产财产的分配方案和其他重要事项，并行使表决权等权利。
综上所述，当申请执行人破产时，其执行案件的处理将受到破产法的严格调整。债权人应充分了解相关法律规定，积极参与破产程序，以最大限度地维护自己的合法权益。