在刑事案件中提交大量聊天记录作为证据材料时，确实会面临整理和提交的难题，不过别担心，以下是具体的处理建议：

1. 筛选关键证据：首先，不需要将所有的聊天记录都作为证据提交。你应该仔细审查这些聊天记录，筛选出与案件直接相关、能够证明案件事实的关键部分。比如，涉及犯罪计划、实施过程、犯罪结果等关键内容的聊天记录，这些才是对案件有实质性帮助的证据。
2. 整理证据材料：筛选出关键证据后，接下来就是整理这些证据材料。你可以按照时间顺序或者主题分类，将聊天记录进行编排。比如，可以按照犯罪行为的发生、发展、结果等时间节点来整理，或者按照不同的犯罪环节、不同的犯罪嫌疑人等主题来分类。这样整理后，证据材料会更加清晰、有条理，便于法庭审查和判断。
3. 制作证据清单：整理好证据材料后，还需要制作一份详细的证据清单。证据清单应该包括证据的名称、来源、数量、证明内容等信息。这样，法庭在审查证据时，就能一目了然地了解每份证据的基本情况和证明作用。同时，证据清单也有助于你在庭审时更加有条理地陈述和举证。
4. 考虑证据形式：对于聊天记录这种电子数据证据，你还需要考虑其形式问题。最好将聊天记录打印出来，并附上电子数据的原始载体（比如手机、电脑等），以便法庭进行核对和审查。如果聊天记录很多，打印出来可能不太现实，那么你可以考虑使用光盘或者其他存储介质来存储电子数据，并在证据清单中注明存储方式和存储路径。

在处理这类问题时，如果感到困惑或不确定如何操作，随时可以向我咨询，我会根据你的具体情况，给出更加详细和专业的建议。