针对您提出的“虚开发票停业怎么处理”的问题，这主要涉及到违反《中华人民共和国发票管理办法》中关于虚开发票的相关规定。以下是我为您详细梳理的处理流程和可能面临的法律后果：
首先，需要明确的是，虚开发票是一种严重的违法行为，它不仅违反了国家的税收管理法规，还可能对国家的财政收入造成损失。因此，一旦被发现虚开发票，税务机关将会采取严厉的措施进行处理。
一、税务机关的处理措施
没收违法所得：对于虚开发票的行为，税务机关首先会没收其违法所得，即因虚开发票而获得的非法利益。
罚款：
停业整顿：虽然直接的“停业”处理可能并非由税务机关单独决定，但虚开发票行为可能导致企业信誉受损，进而影响其正常经营。此外，在严重情况下，税务机关可能会联合其他相关部门，如市场监管部门，对企业进行停业整顿等更严厉的处罚。不过，具体的停业整顿措施通常需要根据相关法律法规和具体情况来判定。
追究刑事责任：如果虚开发票行为构成犯罪，税务机关将依法将案件移送司法机关处理，追究相关责任人的刑事责任。
二、企业应对措施
立即停止虚开发票行为：一旦发现存在虚开发票的情况，企业应立即停止该行为，并主动向税务机关报告，配合调查。
积极整改：企业应认真分析虚开发票的原因，制定整改措施，加强内部管理，确保今后不再发生类似行为。
接受处罚并履行义务：对于税务机关作出的处罚决定，企业应认真接受并按时履行相关义务，如缴纳罚款、补缴税款等。
三、预防措施
为了避免虚开发票等违法行为的发生，企业应加强内部管理，建立健全的发票管理制度和内部控制机制。同时，加强对员工的培训和教育，提高员工的法律意识和合规意识，确保企业经营活动合法合规。
综上所述，虚开发票是一种严重的违法行为，一旦被发现将面临严厉的处罚。因此，企业应严格遵守国家税收管理法规，加强内部管理，确保经营活动合法合规。如果遇到相关问题或疑虑，建议及时咨询专业律师或税务机关以获取更具体的指导和帮助。