国有土地转让纠纷在符合一定条件下是可以仲裁的。以下是对此问题的详细分析：
一、国有土地转让合同的可仲裁性基础
合同性质与仲裁法适用：
- 国有土地转让合同是平等主体之间订立的民事合同，主要涉及土地使用权的转让，不涉及行政机关的行政管理职权。因此，其纠纷属于《中华人民共和国仲裁法》第二条所规定的“平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷”，可以仲裁。
仲裁协议或条款的存在：
- 仲裁的前提是双方当事人存在有效的仲裁协议或仲裁条款。如果国有土地转让合同的当事人在合同中明确约定了仲裁条款，或者双方在纠纷发生前后达成了有效的仲裁协议，明确选定了具体的仲裁机构及仲裁事项，那么因该合同产生的争议就可以通过仲裁方式解决。
二、特殊情况：国有土地使用权出让合同的仲裁性
- 需要注意的是，国有土地使用权出让合同与国有土地转让合同在性质上有所不同。国有土地使用权出让合同是土地使用者与国家（通常通过土地行政主管部门代表）之间订立的，具有一定的行政属性。因此，这类合同中的仲裁条款可能因涉及行政争议而被视为无效。然而，这种争议通常不影响国有土地转让合同的可仲裁性，因为后者是纯粹的民事合同。
三、仲裁申请的条件与流程
仲裁协议的有效性：
- 当事人申请仲裁时，必须提供有效的仲裁协议或仲裁条款作为依据。如果没有仲裁协议或协议无效，则不能通过仲裁方式解决纠纷。
具体的仲裁请求与事实理由：
- 申请人需要明确提出仲裁请求，并附上相关的事实和理由来支持其请求。仲裁请求必须清晰、具体，且属于仲裁委员会的受理范围。
仲裁流程：
- 提交仲裁申请：申请人向选定的仲裁委员会提交仲裁申请书及相关证据材料。
- 仲裁受理：仲裁委员会对申请进行审查，符合受理条件的予以受理，并通知双方当事人。
- 仲裁庭组成：仲裁委员会指定仲裁员组成仲裁庭，负责审理案件。
- 开庭审理：仲裁庭组织双方当事人进行开庭审理，听取双方陈述和辩论，审查证据。
- 仲裁裁决：仲裁庭根据审理情况作出仲裁裁决，裁决具有法律效力。
四、建议与注意事项
- 明确约定纠纷解决方式：在签订国有土地转让合同时，建议当事人明确约定纠纷解决方式，可以选择仲裁或诉讼。如果选择仲裁，应明确约定仲裁机构和仲裁事项。
- 及时咨询专业律师：在发生纠纷时，及时咨询专业律师以获取准确的法律建议。律师可以根据具体情况分析合同的性质、仲裁条款的有效性以及仲裁申请的可行性，为当事人提供有针对性的法律帮助。
综上所述，国有土地转让纠纷在双方明确约定仲裁条款或达成有效仲裁协议的情况下，是可以申请仲裁的。在实际操作中，当事人应谨慎签订合同，并在发生纠纷时及时寻求专业法律帮助以确保自身权益得到妥善保护。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。