若车辆携带的100条烟草为合法来源且已办理相关运输手续，一般不会受到处罚；若未办理相关手续或存在非法运输情形，则可能面临罚款、没收违法所得、没收涉案物品等处罚，情节严重的还可能构成犯罪。以下是对此问题的详细分析：

一、合法运输情形

1. 烟草来源合法：如果车辆所携带的100条烟草是合法购买的，且来源清晰，没有涉及任何非法渠道，那么这部分烟草本身是合法的。
2. 办理运输手续：根据《中华人民共和国烟草专卖法》及相关规定，跨省、自治区、直辖市运输烟草专卖品，除公路联合运输外，必须凭国务院烟草专卖行政主管部门或其授权的机构签发的烟草专卖品准运证。如果已经办理了相应的运输手续，那么运输行为就是合法的，不会受到处罚。

二、非法运输情形

1. 未办理运输手续：如果未办理烟草专卖品准运证而擅自运输烟草专卖品，根据《中华人民共和国烟草专卖法实施条例》第五十二条的规定，将面临没收违法所得，并处以违法运输的烟草专卖品价值20%以上50%以下的罚款。如果同时符合非法经营罪的构成要件，还可能被追究刑事责任。
2. 运输数量超过规定：虽然个人在异地携带烟草制品的限量一般为每人次1万支（即50条），但这一规定主要针对的是个人自用或消费的情况。对于运输行为，更关键的是是否办理了准运证。如果未办理准运证，即使数量未超过个人携带限量，也可能构成非法运输。不过，在实际操作中，如果数量较大（如100条），且未办理准运证，那么处罚可能会更加严厉。
3. 运输假烟或走私烟：如果运输的烟草是假烟或走私烟，那么不仅违反了烟草专卖法规，还可能涉及生产、销售伪劣产品罪或走私罪等刑事犯罪。根据相关法律规定，将面临没收违法运输的烟草专卖品和违法所得，并处以罚款；情节严重的，还可能被追究刑事责任。

三、特殊情形

1. 企业运输：如果是企业运输烟草专卖品，除了需要办理准运证外，还需要确保运输的烟草专卖品与准运证上的内容相符。如果企业未经许可擅自运输烟草专卖品，或者运输的烟草专卖品与准运证上的内容不符，那么将面临更加严厉的处罚。
2. 无烟草专卖零售许可证经营烟草制品零售业务：如果车辆携带烟草的目的是为了进行零售业务，但并未取得烟草专卖零售许可证，那么根据《中华人民共和国烟草专卖法》的规定，将面临责令停止经营烟草制品零售业务、没收违法所得以及罚款等处罚。

温馨提示：在运输烟草专卖品时，请务必确保来源合法、手续齐全，以避免不必要的法律风险。如果您在烟草运输方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。