自收自支事业编制人员能否停薪留职，需分情况讨论，具体如下：
政策依据与单位规定
- 政策层面：目前，我国对于事业单位人员停薪留职的规定，主要依据的是原人事部《关于全民所有制事业单位专业技术人员和管理人员辞职暂行规定》等相关政策，但这些政策多针对的是全额拨款或差额拨款的事业单位。对于自收自支的事业单位，其人事管理往往更加灵活，可能并不完全遵循上述规定。
- 单位规定：自收自支的事业单位，其内部管理制度往往由单位自行制定，并报上级主管部门备案。因此，能否停薪留职，首先需查阅单位的相关规章制度或人事政策。如果单位有明确规定允许或禁止停薪留职，那么应遵循单位规定。
劳动合同与聘用合同
- 合同内容：自收自支事业编制人员与单位之间通常签订的是聘用合同或劳动合同。合同中可能会明确约定双方的权利义务，包括是否可以停薪留职、停薪留职的条件、期限以及待遇等。因此，查看合同内容是判断能否停薪留职的重要依据。
- 合同变更：如果合同中没有明确规定停薪留职的相关条款，但双方协商一致，可以签订补充协议对合同进行变更，明确停薪留职的相关事宜。
实际操作中的考量
- 单位意愿：即使政策或合同允许停薪留职，单位也可能基于工作需要、人员配置等因素，不同意员工停薪留职的申请。
- 员工权益：员工在申请停薪留职时，也应考虑自身的权益保障，如停薪留职期间的社保缴纳、工龄计算、职称评定等是否受到影响。
法律后果与风险
- 违约责任：如果未经单位同意擅自停薪留职，可能构成违约，需要承担相应的违约责任，如赔偿单位损失、解除聘用合同等。
- 劳动关系处理：停薪留职期间，双方的劳动关系可能处于暂停状态，但并未完全解除。因此，在停薪留职期满后，双方应协商是否继续履行原合同或签订新的合同。
建议：
- 如果您是自收自支事业编制人员，想要申请停薪留职，首先应查阅单位的相关规章制度或人事政策，了解单位是否允许停薪留职。
- 同时，查看您与单位签订的聘用合同或劳动合同，确认合同中是否有关于停薪留职的条款。
- 如果单位规定或合同允许停薪留职，且您符合相关条件，可以向单位提出申请，并按照单位的要求办理相关手续。
- 如果单位不同意您的申请，或者合同中没有明确规定，您可以与单位协商，尝试签订补充协议明确停薪留职的相关事宜。
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