医院将吸痰等医疗废物交由医药公司处理是否合法，需分情况讨论：

1. 若医药公司具备医疗废物处理资质：

   • 合法性分析：根据《医疗废物管理条例》及相关规定，医疗废物必须交由具备相应资质的单位进行处理。如果医药公司不仅从事药品销售，还具备医疗废物收集、运输、处置的资质，并且医院与其签订了合法的医疗废物处理合同，那么医院将吸痰等医疗废物交由该医药公司处理是合法的。
   • 建议：医院在处理医疗废物时，应严格审查处理单位的资质，确保其具备处理医疗废物的合法资格，并签订详细的合同，明确双方的权利和义务。

2. 若医药公司不具备医疗废物处理资质：

   • 合法性分析：如果医药公司仅从事药品销售等业务，而不具备医疗废物处理资质，那么医院将吸痰等医疗废物交由其处理是违法的。这种行为可能违反了《医疗废物管理条例》中关于医疗废物必须交由具备资质单位处理的规定，医院可能面临行政处罚，甚至可能因医疗废物处理不当而引发环境污染或公共卫生事件，承担相应的法律责任。
   • 法律后果：根据《医疗废物管理条例》的相关规定，医院若将医疗废物交由不具备资质的单位处理，可能面临警告、罚款等行政处罚。情节严重的，还可能被责令停业整顿，甚至吊销执业许可证。同时，如果因医疗废物处理不当造成环境污染或公共卫生事件，医院还需承担相应的民事赔偿责任和刑事责任。
   • 建议：医院应严格遵守相关法律法规，不得将医疗废物交由不具备资质的单位处理。一旦发现此类行为，应立即停止并纠正，同时加强内部管理，确保医疗废物的合法处理。

额外提醒：

• 医院在处理医疗废物时，应建立完善的医疗废物管理制度，明确医疗废物的分类、收集、运输、处置等环节的责任人和操作流程。
• 医院应定期对医疗废物处理情况进行检查和评估，确保医疗废物得到合法、安全、有效的处理。
• 如果医院对医疗废物处理存在疑问或需要进一步的法律指导，可以直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律意见。