关于户口迁移时亲子鉴定是否可以只做父亲跟孩子的问题，这主要取决于当地户籍管理部门的具体要求以及亲子鉴定的目的。

首先，我们需要明确的是，亲子鉴定在户口迁移中的主要作用是证明亲子关系，以确保户口迁移的合法性和准确性。在大多数情况下，如果父亲和孩子之间的亲子关系明确无误，且没有其他特殊情况（如母亲身份不明或存在争议等），那么只做父亲和孩子的亲子鉴定通常是可以的。

然而，具体是否可行还需参考当地户籍管理部门的规定。不同地区对于户口迁移时亲子鉴定的要求可能有所不同，有些地方可能要求提供父母双方与孩子的亲子鉴定报告，以确保亲子关系的全面性和准确性。因此，在进行亲子鉴定之前，建议您先咨询当地户籍管理部门或相关机构，了解他们的具体要求和流程。

另外，关于亲子鉴定的费用和流程，这也会因地区和机构的不同而有所差异。以惠州地区为例，亲子鉴定的费用通常在1800元至4200元之间，具体项目涵盖个人隐私亲子鉴定、司法用途亲子鉴定和无创胎儿亲子鉴定等。在选择亲子鉴定机构时，请务必选择正规、有资质的机构，以确保鉴定结果的准确性和法律效力。

最后，如果您决定进行亲子鉴定，请按照机构的要求准备好相关材料，并按照规定流程进行操作。在鉴定结果出来后，及时将其提交给户籍管理部门或相关机构，以完成户口迁移手续。

总的来说，户口迁移时亲子鉴定是否可以只做父亲跟孩子，需根据当地户籍管理部门的具体要求来确定。建议您在进行亲子鉴定前，先咨询相关部门或机构，了解他们的具体要求和流程，以确保户口迁移的顺利进行。