结论前置：在交通肇事中，若电动车被鉴定为机动车，但出厂合格证写明为非机动车，这通常意味着该电动车在技术参数上可能超出了非机动车的标准，从而被鉴定机构依据相关法规认定为机动车。这种情况下，车辆的性质认定应以鉴定结论为准，同时需考虑出厂合格证与实际情况的差异及其法律后果。
详细分析：
电动车的分类与鉴定标准：
- 电动车根据其技术参数被划分为非机动车和机动车两类。非机动车，如电动自行车，需满足具有脚踏骑行功能、最高设计时速不超过25km/h、整车质量（含电池）不超过55kg等条件。而机动车，如电动轻便摩托车和电动摩托车，则无脚踏骑行功能，且最高设计时速和整车质量等参数超出非机动车标准。
- 鉴定机构在鉴定电动车时，会依据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关规定，以及《电动自行车安全技术规范》等国家标准文件，对电动车的技术参数进行详细检测，从而确定其是否属于机动车范畴。
出厂合格证与鉴定结论的差异：
- 出厂合格证是车辆生产厂家对车辆质量和技术参数的确认文件，它表明车辆在生产时符合某些标准。然而，这并不意味着车辆在实际使用中或经过改装后仍然符合这些标准。
- 如果电动车在出厂时确实符合非机动车的标准，但在后续使用中因改装、损坏或其他原因导致技术参数发生变化，从而被鉴定为机动车，那么鉴定结论将具有更高的法律效力。因为鉴定结论是基于车辆当前的实际技术参数作出的，更能反映车辆的真实性质。
法律后果与责任承担：
- 如果电动车被鉴定为机动车，那么驾驶人就需要按照机动车的管理规定进行注册登记、上牌、购买保险，并持有相应驾驶证才能上路行驶。如果驾驶人未遵守这些规定，将可能面临交通违法处罚，甚至承担交通事故中的法律责任。
- 同时，如果出厂合格证与鉴定结论存在差异，且这种差异是由于生产厂家的原因导致的（如生产过程中的质量控制不严、虚假标注等），那么生产厂家也可能需要承担相应的法律责任。
法律建议：
- 对于驾驶人而言，如果自己的电动车被鉴定为机动车，应尽快了解并遵守机动车的管理规定，确保车辆合法上路。同时，也可以向生产厂家或销售商咨询车辆性质变更的原因，并寻求相应的解决方案。
- 如果认为鉴定结论存在错误或不合理之处，可以向鉴定机构提出异议，并申请重新鉴定。在重新鉴定过程中，可以提供出厂合格证等证据来支持自己的观点。
- 如果因车辆性质认定问题引发交通事故或法律纠纷，建议及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。
进一步思考：
- 在实际生活中，电动车的改装现象较为普遍。一些驾驶人为了追求更高的速度或更好的性能，会对电动车进行改装。然而，这种改装往往会导致车辆的技术参数发生变化，从而影响车辆的性质认定。因此，驾驶人在改装电动车时应谨慎考虑，并确保改装后的车辆仍然符合非机动车的标准。
- 同时，生产厂家也应加强质量控制和标注管理，确保出厂合格证上的信息真实准确。如果因生产厂家的原因导致车辆性质认定出现问题，生产厂家应承担相应的法律责任。