贪污公司的钱追回后，赃款原则上应返还给公司，但在特定情况下可能上缴国家。以下是对这一问题的详细分析：
一、赃款返还公司的原则
法律基础：
- 根据《中华人民共和国刑法》第六十四条的规定，犯罪分子违法所得的一切财物，应当予以追缴或者责令退赔；对被害人的合法财产，应当及时返还。在贪污公司资金的案件中，公司作为被害人，其被贪污的资金属于合法财产，因此追回的赃款应当返还给公司。
实践操作：
- 在司法实践中，一旦贪污案件被侦破，司法机关会依法追缴赃款。追缴后，司法机关会核实赃款的来源和归属，确认属于公司合法财产的，会及时返还给公司。这有助于恢复公司的正常经营秩序，减少损失。
二、赃款上缴国家的特定情况
无法确定被害人或被害人已不存在：
- 如果贪污案件中的赃款无法确定具体被害人，或者被害人（如公司）已经不存在（如破产、注销等），那么追回的赃款可能会上缴国家。这是因为在此情况下，赃款无法返还给具体的合法所有人，只能上缴国库。
赃款已转化为其他形式或混合财产：
- 如果贪污的赃款已经被犯罪分子转化为其他形式的财产（如投资、购房等），或者与犯罪分子的其他财产混合在一起，难以分割，那么司法机关可能会根据具体情况，将部分或全部赃款上缴国家。这通常发生在贪污案件复杂、赃款去向难以追踪的情况下。
法律另有规定：
- 除了上述情况外，如果法律对赃款的处理有特别规定（如特定类型的贪污案件、特定金额的赃款等），司法机关也会按照法律规定进行处理。这可能包括将赃款上缴国家、用于公益事业等。
三、法律建议
公司应积极配合司法机关：
- 在贪污案件发生后，公司应积极配合司法机关的调查和追缴工作，提供必要的证据和资料，以便司法机关能够尽快追回赃款并返还给公司。
公司应加强内部管理：
- 为了防止类似贪污案件的发生，公司应加强内部管理，建立健全的财务制度和监督机制，确保公司资金的安全和合规使用。
公司应寻求法律援助：
- 如果公司在贪污案件中遭受了重大损失，或者对赃款的处理有疑问，可以寻求专业律师的法律援助，以便更好地维护公司的合法权益。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业的法律意见和解决方案。