代加工食品不合格的处罚措施主要包括行政处罚、刑事处罚以及民事赔偿三个方面，具体如下：

一、行政处罚

1. 没收违法所得与违法物品

   • 对于因代加工不合格食品所获得的非法收入，以及用于违法生产经营的食品、食品添加剂、工具、设备、原料等物品，相关部门将全部予以没收。

2. 罚款

   • 若违法生产经营的食品、食品添加剂货值金额不足一万元，将处以五万元以上十万元以下的罚款。
   • 若货值金额一万元以上，将处以货值金额十倍以上二十倍以下的罚款。

3. 责令停产停业

   • 相关部门将责令存在不合格食品问题的代加工企业暂停其生产和销售活动，直至问题得到妥善解决。

4. 吊销许可证

   • 对于情节严重、屡教不改或造成严重后果的违法代加工企业，相关部门将依法吊销其食品生产或经营许可证。

5. 特殊情形

   • 如在食品中添加药品（传统既是食品又是中药材的物质除外），货值金额不足一万元时，罚款为十万元以上十五万元以下；货值金额一万元以上时，罚款为货值金额十五倍以上三十倍以下，并可能面临公安机关对直接负责的主管人员和其他直接责任人员的拘留处罚。

二、刑事处罚

若代加工不合格食品行为构成犯罪，如生产、销售不符合安全标准的食品罪，将依法追究刑事责任。具体刑事责任依据《中华人民共和国刑法》的相关规定进行处罚，根据销售金额和造成的危害程度，可能面临三年以下有期徒刑、拘役、罚金，直至七年以上有期徒刑、无期徒刑，并处罚金或没收财产的严厉惩罚。例如，若代加工的食品足以造成严重食物中毒事故或其他严重食源性疾病，将处三年以下有期徒刑或拘役，并处罚金；若对人体健康造成严重危害或有其他严重情节，将处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。

三、民事赔偿

根据《食品安全法》的规定，权益受到侵害的消费者有权要求赔偿，代加工企业作为生产者，需承担相应的赔偿责任。具体包括：

1. 十倍赔偿：消费者可向代加工企业索取相当于购买食品价款十倍的赔偿金。
2. 三倍经济损失赔偿：若消费者因食用不合格食品而遭受经济损失，除可要求赔偿经济损失外，还可要求支付损失的三倍作为赔偿金。
3. 最低赔偿额保障：若上述赔偿金额低于一千元，则应以一千元作为最低赔偿额。

总结与建议：

代加工食品不合格的处罚措施涵盖行政处罚、刑事处罚和民事赔偿三个方面，具体处罚力度将根据违法行为的严重程度、货值金额以及造成的后果等因素综合确定。对于代加工企业来说，必须严格遵守相关法律法规，确保食品质量与安全，以避免可能的法律风险和赔偿责任。若您作为代加工企业面临此类问题，或作为消费者因食用不合格代加工食品而受损，均可直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议和帮助。