核心结论：公司贷款时法人已变更且贷款已转3年，需根据贷款合同约定、变更手续合法性及债权人态度等不同情况，采取相应措施来处理后续事宜。以下是具体分析：

从贷款合同约定角度

1. 合同有明确约定法人变更处理方式
   • 如果贷款合同中明确规定了在公司法人发生变更时，对于贷款的具体处理方式，比如是否需要重新签订合同、是否需要提供新的担保等。那么公司和相关方应当严格按照合同约定来执行。例如，合同约定法人变更后需在一定期限内办理贷款主体变更手续，那么公司就应及时与贷款银行沟通，按照要求完成变更登记等相关操作，以确保贷款关系的合法性和有效性。
2. 合同未明确约定法人变更处理方式
   • 若贷款合同对此没有明确约定，根据《民法典》相关规定，合同生效后，当事人不得因姓名、名称的变更或者法定代表人、负责人、承办人的变动而不履行合同义务。所以，原公司（现法人变更后的公司）仍然需要继续承担还款责任。不过，为了避免后续可能出现的纠纷，建议公司与贷款银行进行协商，就法人变更后贷款的相关事宜达成补充协议，明确双方的权利和义务。

从法人变更手续合法性角度

1. 法人变更手续合法合规
   • 如果公司的法人变更手续是依法依规完成的，经过了工商行政管理部门的核准登记，那么新的法人代表将代表公司行使权利和承担义务。在这种情况下，对于已转3年的贷款，公司应按照正常的还款计划继续还款。同时，新的法人代表有责任了解公司的贷款情况，并确保公司按时足额还款，以维护公司的信用记录。如果公司出现还款困难等情况，新的法人代表应积极与贷款银行沟通，寻求解决方案，如协商调整还款计划、申请贷款展期等。
2. 法人变更手续存在瑕疵
   • 若法人变更手续存在瑕疵，例如未按照规定进行登记公示、变更程序不符合法律规定等，可能会影响到法人变更的效力。在这种情况下，一旦发生贷款纠纷，可能会给公司带来不必要的法律风险。公司应及时补办相关手续，使法人变更合法有效。如果因为手续瑕疵已经导致贷款方面出现问题，公司应积极与贷款银行沟通，说明情况，争取银行的理解和支持，同时尽快完善手续，以降低法律风险。

从债权人（贷款银行）态度角度

1. 债权人认可法人变更及贷款转移
   • 如果贷款银行认可公司的法人变更以及贷款已经转移（如果有相关转移手续）的情况，并且同意继续按照原有的贷款合同执行，那么公司只需按照合同约定的还款方式和期限继续还款即可。在此过程中，公司应保持良好的沟通，及时向银行提供公司的经营状况和财务信息，以便银行了解公司的还款能力。
2. 债权人对法人变更或贷款转移有异议
   • 若贷款银行对公司的法人变更或贷款转移存在异议，认为可能影响到贷款的安全和回收，银行可能会采取一些措施，如要求公司提前还款、增加担保等。公司应积极与银行进行协商，了解银行提出异议的原因，并提供相关的证明材料和解释说明，争取银行的理解和信任。如果协商无果，公司可以考虑通过法律途径解决纠纷，但这需要综合考虑诉讼成本、胜诉可能性等因素。

建议：鉴于公司贷款及法人变更情况较为复杂，涉及多方面的法律问题和风险，建议你梳理好相关合同、变更手续等材料，如有疑问或需要进一步帮助，可直接向我咨询，我会结合具体情况为你提供更详细准确的法律建议。