在新生儿死亡且涉及法律程序的情况下，并非一定会进行尸检，但尸检在确定死因和明确责任方面具有关键作用，且法律有相关规定和要求。以下是对此问题的详细解答：
一、尸检的法律规定
根据《医疗纠纷预防和处理条例》的相关规定，当发生医疗纠纷且患者死亡时，医疗机构有义务告知其近亲属有关尸检的规定。具体来说：
尸检告知义务：医疗机构应当明确告知患者近亲属尸检的时间限制（通常为患者死亡后48小时内，具备尸体冻存条件的可延长至7日）以及法律后果。这一告知义务的履行应当以书面等法定形式固定，并经患方签字确认，否则即视为未履行告知义务。
尸检的必要性：如果医患双方对死因有异议，尸检是查明死因的科学手段。通过尸检，可以明确新生儿的死亡原因，进而判断医疗机构的诊疗行为是否存在过错，以及过错与死亡之间是否存在因果关系。
二、尸检在法律程序中的作用
在新生儿死亡的法律程序中，尸检结果往往成为判断医疗机构责任的关键证据。如果医疗机构未履行尸检告知义务，或者因其他原因导致无法进行尸检，可能会面临以下法律后果：
不利后果的承担：如果因医疗机构不同意或拖延尸检，超过规定时间影响对死因判定的，由不同意或拖延的一方承担责任。在本案中，医院未按照规定向患方告知尸检事宜，错过了查明真相的时机，因此承担了不利后果。
证据效力的削弱：如果医疗机构未能妥善保管与新生儿死亡相关的证据（如抢救过程视频等），或者提供的证据存在矛盾或瑕疵，可能会削弱其在法律程序中的证据效力。在本案中，医院未能妥善保管新生儿抢救过程的视频资料，且陈述存在矛盾，直接影响了法院对关键事实的认定。
三、实际案例分析
以您提供的案例为例，新生儿娩出后死亡，患方认为医疗机构存在医疗过错并起诉要求赔偿。在诉讼过程中，医患双方对新生儿出生时是活体还是死体存在争议。这一争议焦点本可通过专业的尸检予以确定，但医院未履行尸检告知义务，且未能提供充分证据证明其主张，因此法院最终认定新生儿出生时为活体，并判决医院承担相应责任。
四、建议与总结
医疗机构应履行尸检告知义务：在新生儿死亡且涉及医疗纠纷时，医疗机构应当严格按照法律规定履行尸检告知义务，确保患方了解尸检的必要性和时间限制。
妥善保管相关证据：医疗机构应当妥善保管与新生儿死亡相关的所有证据（如病历、抢救记录、监控视频等），以便在法律程序中提供充分、有效的证据支持其主张。
积极应对法律程序：在医疗纠纷进入法律程序后，医疗机构应当制定合理的诉讼策略，准确把握争议焦点，及时提供有效证据，避免因诉讼策略失误导致不利后果。
综上所述，虽然新生儿死亡走法律程序并不一定会进行尸检，但尸检在确定死因和明确责任方面具有关键作用。医疗机构应当严格遵守法律规定，履行尸检告知义务，并妥善保管相关证据，以应对可能出现的法律纠纷。