货运公司伪造机动车维修竣工出厂合格证，将面临行政处罚，情节严重的还可能承担刑事责任。具体分析如下：

1. 行政处罚：

   • 根据《中华人民共和国道路运输条例》第七十三条，货运公司若伪造机动车维修竣工出厂合格证，将由县级以上道路运输管理机构责令改正，没收违法所得，并处以违法所得2倍以上10倍以下的罚款。若违法所得不足1万元，则处2万元以上5万元以下的罚款；情节严重的，还将由原许可机关吊销其道路运输经营许可证。
   • 此外，若该行为同时违反了《中华人民共和国产品质量法》的相关规定，如伪造或者冒用认证标志等质量标志，还将面临责令改正、没收违法生产、销售的产品，并处违法生产、销售产品货值金额等值以下罚款的处罚；若违法所得情节严重，还可能被吊销营业执照。

2. 刑事责任：

   • 如果货运公司伪造机动车维修竣工出厂合格证的行为情节严重，构成犯罪的，将依法追究刑事责任。例如，若伪造合格证的行为涉及伪造、变造、买卖国家机关公文、证件、印章罪，根据《中华人民共和国刑法》第二百八十条，将处三年以下有期徒刑、拘役、管制或者剥夺政治权利，并处罚金；情节严重的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。

建议：货运公司应严格遵守相关法律法规，确保机动车维修竣工出厂合格证的真实性和合法性。若已存在伪造行为，应立即停止并主动向相关部门报告，积极配合调查，以减轻或避免可能的法律责任。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。