在面临长期与第三者保持不正当关系的情况时，若希望通过纪检部门进行取证，需要明确的是，纪检部门的职责主要侧重于对党员干部和公职人员的纪律监督，而非直接介入个人的婚姻纠纷或私德问题。因此，通过纪检部门直接取证可能并不是最合适的途径。以下是我从法律角度为您提供的建议：

1. 明确取证目的与合法性：

   • 首先，明确您取证的目的，是为了在离婚诉讼中作为证据使用，还是为了其他法律程序。
   • 确保取证手段合法，不得侵犯他人的合法权益，如隐私权、名誉权等。

2. 通过私人途径取证：

   • 您可以尝试通过私人途径收集证据，如聊天记录、短信、邮件等电子数据，或者第三者的公开社交媒体动态。
   • 这些证据需要确保真实、完整，且能够证明不正当关系的存在。

3. 寻求专业法律帮助：

   • 如果您不熟悉法律程序或取证技巧，建议咨询专业律师。律师可以为您提供具体的法律建议，帮助您制定合适的取证策略。
   • 律师还可以协助您评估证据的有效性，以及如何在法律程序中有效使用这些证据。

4. 考虑其他法律途径：

   • 如果不正当关系导致了财产损失或其他法律后果，您可以考虑通过民事诉讼或刑事诉讼来维护自己的权益。
   • 在这些法律程序中，您可能需要提供充分的证据来支持您的主张。

5. 注意保护个人隐私：

   • 在取证过程中，务必注意保护自己和他人的个人隐私。不得公开传播或滥用收集到的证据。

综上所述，通过纪检部门直接取证可能并不是解决您问题的最佳途径。建议您明确取证目的与合法性，通过私人途径或专业法律帮助来收集证据，并考虑其他法律途径来维护自己的权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。