出纳兼审计是不合法的，这种做法违反了内部审计的独立性原则。以下是对这一问题的详细解答：

一、法律法规依据

根据《广东省内部审计工作规定》（粤府令第259号）等相关法规，内部审计是指单位负责内部审计的机构和人员对本单位及所属单位财政财务收支、经济活动、内部控制、风险管理以及内部管理领导人员履行经济责任情况等，实施独立、客观监督并作出评价和建议，以促进单位完善治理、实现目标的行为。其中明确规定，单位负责财务工作的机构不得同时履行内部审计职责，且内部审计机构和内部审计人员不得从事可能影响独立、客观履行审计职责的工作，如会计、出纳等财务管理业务。

二、独立性原则的重要性

内部审计的核心在于其独立性。独立性是内部审计工作的基石，它确保了审计人员能够客观、公正地评价单位的财务收支、经济活动等，从而提出真实、准确的审计意见和建议。如果出纳等财务人员同时兼任审计工作，将会严重损害审计的独立性，导致审计结果可能受到财务利益的影响，无法真实反映单位的经济状况和问题。

三、实际案例与整改措施

以某区直部门为例，其财务部门原本承担了局机关和下属预算管理单位的预决算、财务、资产管理以及内部审计等工作。然而，在区审计局的专项检查中，发现这种做法违反了内部审计的独立性原则。区审计局及时发出了《整改函》，建议该部门将内部审计职责从财务机构中独立出来，确保内部审计机构的独立性。该部门积极响应，召开班子会议深入研究，及时纠正了这一问题，将内部审计工作职责调整至其他符合规定的内设机构，并补充了专业人员充实内部审计队伍。

四、建议与总结

为了确保内部审计工作的有效性和公正性，单位应严格遵守相关法律法规，确保内部审计机构的独立性。具体来说，可以采取以下措施：

1. 明确内部审计机构的设置和职责：单位应设立独立的内部审计机构，并明确其职责和权限，确保审计工作不受其他部门的干扰和影响。
2. 配备专业的审计人员：单位应配备具有专业知识和技能的审计人员，确保他们能够胜任审计工作，并保持客观、公正的态度。
3. 加强内部审计工作的指导和监督：国家审计机关应加强对内部审计工作的指导和监督，确保各单位合法合规合理地设置内部审计机构和配备审计人员。

综上所述，出纳兼审计是不合法的，这种做法违反了内部审计的独立性原则。单位应严格遵守相关法律法规，确保内部审计工作的有效性和公正性。