公司章程备案并不等同于股东变更完成备案，二者是不同的法律程序，需分别进行。以下从几个方面详细解释：
一、公司章程备案与股东变更备案的定义及目的
公司章程备案：公司章程是公司设立时必须制定的基本法律文件，它规定了公司的组织结构、经营范围、股东权利与义务等重要事项。公司章程备案是指公司将制定或修改后的公司章程提交给相关登记机关（如市场监督管理局）进行存档备查的过程。其目的在于确保公司章程的合法性和公开性，便于监管机关和社会公众查询和监督。
股东变更备案：股东变更是指公司股东因转让股权、增资扩股、继承等原因导致股东结构发生变化的情况。股东变更备案是指公司将股东变更情况提交给相关登记机关进行登记备案的过程。其目的在于确保公司股东信息的准确性和及时性，保护股东的合法权益，并便于监管机关对公司股东结构进行监管。
二、公司章程备案与股东变更备案的关系
虽然公司章程中通常会包含股东信息，但公司章程备案并不直接等同于股东变更备案。公司章程备案主要关注的是公司章程本身的合法性和公开性，而股东变更备案则专注于股东结构的变化情况。因此，即使公司章程已经备案，如果股东结构发生了变化，公司仍然需要单独进行股东变更备案。
三、实际操作中的注意事项
分别进行备案：公司在进行公司章程修改或股东变更时，应分别按照相关法律法规的规定，向登记机关提交相应的备案材料，并完成备案手续。
确保信息准确：公司在提交备案材料时，应确保所提交的信息真实、准确、完整。如果信息有误或遗漏，可能会导致备案失败或引发法律纠纷。
关注时间节点：公司应关注相关法律法规规定的备案时间节点，确保在规定的时间内完成备案手续。逾期未备案可能会面临行政处罚等法律后果。
四、法律后果
如果公司未按照相关法律法规的规定进行公司章程备案或股东变更备案，可能会面临以下法律后果：
行政处罚：登记机关有权对未按规定进行备案的公司进行行政处罚，如罚款、责令改正等。
法律纠纷：未备案或备案信息不准确可能导致公司与其他股东、债权人等利益相关方之间产生法律纠纷，影响公司的正常运营和声誉。
建议：公司在进行公司章程修改或股东变更时，务必按照相关法律法规的规定，分别进行备案手续，并确保所提交的信息真实、准确、完整。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。