纠纷结清后签订协议的核心要点是明确双方权利义务终止、避免后续争议，协议需包含纠纷事实、结清方式、权利义务终止条款及违约责任等内容。以下是具体说明及协议模板参考：

一、协议核心内容

1. 纠纷事实描述
   需简明扼要写明纠纷起因、双方争议焦点（如合同履行、侵权赔偿等），避免模糊表述。例如：”双方因XX合同第X条履行问题产生争议，甲方主张乙方未按时交付货物，乙方主张甲方未支付货款”。

2. 结清方式与金额

   • 明确结清方式（现金/转账/货物抵偿等）、金额（大写+小写）、支付时间节点。
     
   • 若涉及分期支付，需写明每期金额、支付时间及逾期责任。
     
   • 示例：”乙方于202X年X月X日前通过银行转账向甲方支付人民币50,000元（大写：伍万元整）”。

3. 权利义务终止条款

   • 写明”双方确认，本协议签署后，原纠纷涉及的所有权利义务关系终止，任何一方不得再以同一事实向对方主张权利”。
     
   • 若涉及合同解除，需明确”原合同自本协议生效之日起解除”。

4. 违约责任

   • 约定一方未履行协议的违约责任（如支付违约金、赔偿损失等）。
     
   • 示例：”若乙方未按期支付，每逾期一日，按未付金额的0.05%向甲方支付违约金”。

5. 争议解决方式

   • 约定后续争议解决途径（如协商、诉讼/仲裁管辖地）。
     
   • 示例：”因本协议产生的争议，双方应协商解决；协商不成的，提交甲方所在地人民法院诉讼解决”。

二、协议模板参考

纠纷结清协议
甲方（姓名/名称）：________
乙方（姓名/名称）：________

鉴于双方因________（纠纷事由）产生争议，经协商一致，达成如下协议：

1. 纠纷事实：双方确认，________（简述纠纷起因及争议焦点）。
   
2. 结清方式：乙方于_____前向甲方支付人民币__元（大写：__），支付方式为_____。
   
3. 权利义务终止：本协议签署后，双方就原纠纷的权利义务关系终止，不得再以同一事实主张权利。
   
4. 违约责任：若乙方未按期支付，每逾期一日，按未付金额的________%支付违约金。
   
5. 争议解决：因本协议产生的争议，提交________（法院/仲裁机构）解决。
   

甲方（签字/盖章）：________
乙方（签字/盖章）：________
日期：________

三、注意事项

1. 主体资格：确保双方具备民事行为能力（如个人需年满18周岁，公司需加盖公章）。
   
2. 意思表示真实：协议内容需双方自愿，无胁迫、欺诈情形。
   
3. 合法性：协议内容不得违反法律强制性规定（如免除故意伤害责任）。
   
4. 保留证据：结清后建议留存支付凭证（如转账记录、收条）。
   

如有具体纠纷类型（如合同纠纷、侵权赔偿等），可进一步细化条款。若有疑问，可直接向我咨询。