窃取军事秘密的认定程序主要涉及立案、侦查、审查起诉和审判等阶段，具体流程和要点如下：

一、立案阶段

1. 报案与受理：当发现有人涉嫌窃取军事秘密时，相关单位或个人应立即向公安机关或国家安全机关报案。公安机关或国家安全机关在接到报案后，会进行初步审查，判断是否符合立案条件。
2. 立案条件：根据《中华人民共和国刑法》及相关司法解释，窃取军事秘密的行为需达到一定的严重程度，如涉及国家军事机密、造成严重后果等，才构成犯罪并予以立案。具体来说，窃取、刺探、收买、非法提供军事秘密的行为，情节严重的，即构成窃取军事秘密罪。这里的“情节严重”，通常指的是窃取的军事秘密属于机密级以上，或者造成严重后果，如影响军事行动、损害国家军事利益等。

二、侦查阶段

1. 侦查措施：立案后，公安机关或国家安全机关会依法展开侦查工作，包括询问嫌疑人、证人，调取相关证据，进行技术侦查等。在侦查过程中，侦查机关会严格遵守法定程序，确保侦查活动的合法性和有效性。
2. 证据收集：侦查机关会重点收集能够证明嫌疑人实施窃取军事秘密行为的证据，如窃取的军事秘密文件、电子数据、通讯记录等。同时，还会收集能够证明嫌疑人主观故意和犯罪情节的证据，如嫌疑人的供述、证人证言、鉴定意见等。

三、审查起诉阶段

1. 审查起诉：侦查终结后，公安机关或国家安全机关会将案件移送人民检察院审查起诉。人民检察院在审查起诉阶段，会对案件事实、证据和法律适用进行全面审查，判断是否符合起诉条件。
2. 起诉条件：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的规定，人民检察院认为犯罪嫌疑人的犯罪事实已经查清，证据确实、充分，依法应当追究刑事责任的，会作出起诉决定，并按照审判管辖的规定，向人民法院提起公诉。

四、审判阶段

1. 开庭审理：人民法院在受理人民检察院提起的公诉后，会依法组成合议庭，开庭审理案件。在庭审过程中，法庭会听取公诉人、被告人及其辩护人的意见，审查证据，查明事实，并依法作出判决。
2. 判决结果：根据案件事实和法律规定，人民法院会作出有罪或无罪的判决。如果被告人被认定构成窃取军事秘密罪，法院会根据犯罪情节和法律规定，判处相应的刑罚，如有期徒刑、拘役、管制或剥夺政治权利等。

在认定窃取军事秘密的过程中，还需注意以下几点：

• 军事秘密的范围：军事秘密包括军事设施、军事行动、军事装备、军事技术等方面的秘密信息。在认定窃取军事秘密时，需明确所窃取的信息是否属于军事秘密范畴。
• 主观故意的认定：窃取军事秘密罪要求行为人具有主观故意，即明知是军事秘密而故意窃取。在认定时，需结合行为人的供述、证人证言等证据，判断其是否具有主观故意。
• 犯罪情节的考量：在量刑时，法院会综合考虑犯罪情节的严重程度，如窃取的军事秘密级别、造成的后果等。情节越严重，量刑越重。

若您或他人涉嫌窃取军事秘密，建议立即停止相关行为，并主动向公安机关或国家安全机关投案自首，以争取从轻或减轻处罚。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。