结论：物业公司在收取物业费和公摊费时额外扣除1%的税，这一行为是否合法，主要取决于该税费的性质、税率以及物业公司是否具备代收代缴的合法资质。若该税费为合法税种且税率正确，同时物业公司具备代收代缴资质，则此行为合法；反之，则可能不合法。以下从多个角度进行分析：
一、税费性质与税率
合法税种：
- 物业公司收取的税费应当是法律、行政法规明确规定的税种。例如，如果涉及的是增值税，那么需要确认物业公司是否按照增值税的相关规定进行申报和缴纳。
- 法律依据：根据《中华人民共和国税收征收管理法》及相关税法规定，只有法律、行政法规规定的税种、税率，才能作为征税的依据。
税率正确性：
- 即使税费性质合法，税率也必须正确。如果物业公司按照错误的税率收取税费，那么这一行为也是不合法的。
- 举例：假设增值税税率为6%，但物业公司却按照1%的税率收取，这显然是不合法的。不过，也存在特定情况下税率优惠或简易计税方法导致实际税率低于标准税率的情况，但这需要具体依据税法规定和税务机关的核准。
二、物业公司资质
代收代缴资质：
- 物业公司如果代收代缴税费，必须具备相应的资质和授权。这通常意味着物业公司需要与税务机关签订代收代缴协议，并按照协议规定的方式和标准进行代收代缴。
- 法律依据：根据《中华人民共和国税收征收管理法实施细则》等相关规定，代收代缴税款必须严格依照法律、行政法规的规定执行，且代收代缴单位必须具备相应的资质和条件。
无资质代收代缴：
- 如果物业公司不具备代收代缴资质，却擅自收取税费，那么这一行为不仅不合法，还可能构成违法行为，如偷税漏税等。
三、实际操作与合规性
透明公开：
- 物业公司在收取税费时，应当向业主明确说明税费的性质、税率以及代收代缴的依据和资质。如果物业公司未能做到透明公开，那么业主有权质疑其收费的合法性。
- 建议：业主可以要求物业公司出示相关的税务登记证、代收代缴协议等文件，以验证其收费的合法性。
合规性审查：
- 业主如果对物业公司的收费行为存在疑问，可以向当地税务机关进行咨询或举报。税务机关将对物业公司的收费行为进行审查，并依法处理违法行为。
四、特殊情况考虑
- 地方政策差异：不同地区可能存在不同的税收政策和规定。因此，在判断物业公司收费是否合法时，还需要考虑当地的具体政策。
- 合同约定：如果业主与物业公司签订的物业服务合同中明确约定了税费的收取方式和标准，那么双方应当按照合同约定执行。但合同约定也不得违反法律、行政法规的强制性规定。
总结与建议：物业公司收取物业费和公摊费时额外扣除1%的税是否合法，需要综合考虑税费性质、税率、物业公司资质以及实际操作与合规性等多个因素。如果您对物业公司的收费行为存在疑问或不满，建议您先与物业公司进行沟通协商，要求其出示相关的税务登记证、代收代缴协议等文件以验证其收费的合法性。如果沟通无果或您认为物业公司的收费行为存在违法行为，您可以向当地税务机关进行咨询或举报。如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。