在商家承认证书与实物不一致的情况下，申请假一赔三通常不需要重新鉴定。以下是详细分析：

1. 商家承认的效力：

   • 商家已经承认证书与实物不一致，这本身就是一种自认行为，具有法律效力。
   • 这种自认行为可以直接作为证据使用，无需再通过其他方式证明。

2. 假一赔三的法律基础：

   • 假一赔三通常基于消费者权益保护法的相关规定，特别是针对欺诈行为的赔偿。
   • 商家承认的证书与实物不一致，很可能构成欺诈行为，因此消费者有权要求假一赔三。

3. 重新鉴定的必要性：

   • 在商家已经承认的情况下，重新鉴定并非必要步骤。
   • 重新鉴定通常用于争议解决中，当双方对某一事实存在争议时，通过第三方机构进行鉴定以明确事实。但在此情况下，商家已经自认，无需再通过鉴定来确认。

4. 后续行动建议：

   • 消费者可以与商家协商赔偿事宜，要求商家按照假一赔三的标准进行赔偿。
   • 如果商家拒绝赔偿或协商无果，消费者可以向消费者协会投诉或向法院提起诉讼，维护自己的合法权益。

综上所述，商家承认证书与实物不一致时，消费者申请假一赔三通常不需要重新鉴定。消费者可以直接依据商家的自认行为要求赔偿，并视情况采取后续行动。