在诉讼进行期间企业发生合并的，需根据合并类型提交相应主体材料，具体如下：

1. 吸收合并情形
   若企业被其他企业吸收合并（即合并后注销独立法人资格），需提交：
   

• 工商登记材料：包括市场监管部门出具的《准予变更登记通知书》，证明原企业已注销登记；
  
• 合并协议：需体现合并双方权利义务分配条款，尤其需明确原企业的诉讼权利义务由存续企业承继；
  
• 存续企业主体证明：如最新营业执照副本、法定代表人身份证明，证明其诉讼主体资格。
  

1. 新设合并情形
   若企业与其他企业新设成立新主体（即原企业均注销），需提交：
   

• 工商登记材料：包括新企业的《营业执照》及市场监管部门出具的《准予设立登记通知书》；
  
• 合并协议：需明确原企业的诉讼权利义务由新设企业承继；
  
• 新企业主体证明：如法定代表人身份证明、公司章程（需体现合并后股权结构）。
  

特别提示：

• 若合并涉及跨境主体，还需提交公证认证文件（如境外企业主体资格证明）；
  
• 合并后企业需在提交材料时同步向法院提交《诉讼主体变更申请书》，明确承继诉讼权利义务的具体范围；
  
• 建议同步准备合并前企业的财务审计报告、债权债务清单等辅助材料，以证明合并程序的合法性。
  

如需进一步分析合并对诉讼程序的具体影响（如管辖权变更、诉讼时效中断等），可直接向我咨询。