农业银行信用卡持卡人在遇到还款困难时，确实是有可能与银行协商还本金的，但这一过程需要满足一定的条件，并遵循相关的法律法规和银行政策。以下是对此问题的详细解答：
一、协商还款的法律依据
根据《商业银行信用卡业务监督管理办法》第七十条，当持卡人面临特殊情况，如重大疾病、失业、意外事故等不可抗力因素，导致信用卡欠款金额超出其还款能力，但仍有还款意愿时，发卡银行应与持卡人平等协商，达成个性化分期还款协议。这一规定为信用卡协商还款提供了明确的法律依据，农业银行作为发卡银行之一，同样需要遵循这一规定。
二、协商还款的条件
特殊困难：持卡人需要证明自身确实存在特殊情况，如失业、突发重大疾病、意外伤残等，导致暂时失去还款能力。这是协商还款的前提条件，持卡人需要提供相关证明材料，如医院诊断证明、失业证明等。
还款意愿：持卡人必须表现出积极的还款意愿，愿意与银行合作解决问题。这有助于增加协商成功的可能性，银行在评估时会考虑持卡人的还款态度和诚意。
合理方案：持卡人需要提出合理的还款方案，如延长还款期限、减免部分利息或滞纳金，甚至协商只还本金等。方案应切实可行，并符合银行的利益，银行会根据持卡人的实际情况和还款能力进行评估。
三、协商还款的具体方式
在协商还款时，持卡人可以与银行探讨以下几种方式：
个性化分期还款：将信用卡欠款分成若干期进行偿还，每期需还一定的本金和手续费。如果持卡人希望只还本金，可以与银行协商减免利息和滞纳金，但具体能否成功需看银行政策。
延期还款：向银行申请延长当期账单的还款日期，以减轻短期内的还款压力。但延期期限通常较短，且可能产生一定的延期费用。
“停息挂账”：在特殊情况下，银行可能会同意暂停计算利息，将欠款本金和已产生的利息重新分期。持卡人按新的分期计划按时还款，期间不再产生新利息，但可能有手续费。这种方式下，持卡人有可能与银行协商只还本金部分。
四、协商还款的流程
主动联系银行：持卡人应在发现可能无法按时还款时，尽早主动联系农业银行信用卡客服，表达协商还款的意愿。
提交材料：根据银行要求，持卡人可能需要提交相关证明材料，如失业证明、医疗证明等，以支持自己的协商请求。
等待审核：银行会对持卡人的情况进行审核，评估其还款能力和诚意。审核过程可能需要一定时间，持卡人需要耐心等待。
达成协议：如果审核通过，银行会与持卡人达成个性化分期还款协议，明确还款金额、期限和方式等细节。双方应签订书面协议，以确保权益得到保障。
五、协商还款的注意事项
保持诚实透明：在协商过程中，持卡人应如实说明自己的困难和还款能力，避免提供虚假信息或隐瞒重要事实。
积极沟通：持卡人应保持与银行的良好沟通，及时回应银行的要求和询问。这有助于加快协商进程并提高成功率。
严格履行协议：一旦达成协议，持卡人应严格按照约定履行还款义务。如果再次违约，可能会面临更严重的法律后果和信用损失。
了解费用：在协商还款前，持卡人应充分了解可能产生的费用，如手续费、利息等。确保自己能够承担这些费用，并避免不必要的经济负担。
综上所述，农业银行信用卡持卡人在遇到还款困难时，确实有可能与银行协商还本金。但这一过程需要满足一定的条件，并遵循相关的法律法规和银行政策。持卡人应保持诚实透明、积极主动的态度，与银行进行良好沟通，并严格按照协商后的还款计划进行还款。