农商行公积金贷逾期后重新协商的协议是否会上传至APP，这主要取决于农商行的具体操作流程和规定，无法一概而论，但我可以从几个可能的角度为你分析：

1. 银行内部操作流程：

   • 农商行在处理贷款逾期后重新协商的协议时，可能会有一套内部的操作流程。这套流程可能包括将协议内容录入系统、上传至APP供客户查看等步骤。然而，并非所有银行都会选择将此类协议上传至APP，因为这可能涉及到数据安全、隐私保护以及系统维护等多方面的考虑。

2. 协议性质与内容：

   • 重新协商的协议通常包含贷款金额、利率、还款期限等关键信息。这些信息对于银行和客户双方都至关重要。如果银行认为将这些信息上传至APP有助于提升客户体验、增强透明度，那么他们可能会选择这样做。反之，如果银行出于安全或隐私考虑，可能不会选择上传。

3. 技术实现与成本：

   • 上传协议至APP需要相应的技术支持和系统维护。银行需要评估这一操作的可行性、成本以及可能带来的风险。如果技术实现难度较大或成本过高，银行可能会选择其他方式（如纸质协议、电子邮件等）来与客户确认和保存协议。

4. 客户沟通与确认：

   • 无论银行是否选择将协议上传至APP，他们都需要确保客户已经充分理解并同意协议内容。这通常通过客户签字、确认邮件或短信等方式实现。因此，即使协议没有上传至APP，客户也可以通过其他方式获取和确认协议内容。

建议：

• 如果你对农商行公积金贷逾期后重新协商的协议是否会上传至APP有疑问，最直接的方式是联系农商行的客服或贷款部门进行咨询。他们可以根据你的具体情况和银行的规定给出准确的答复。
• 同时，你也可以在协商过程中主动询问银行工作人员关于协议保存和查看的方式，以便更好地了解和管理自己的贷款情况。

后续行动：

• 如果你已经与农商行就逾期贷款进行了重新协商，并签订了新的协议，建议你仔细阅读协议内容，确保自己完全理解并同意其中的各项条款。
• 如果你对协议内容有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见。