农村自建房在符合法定条件的情况下可以申请财产保全。以下从多个角度进行分析：
法律依据角度： 根据《中华人民共和国民事诉讼法》第一百零三条，人民法院对于可能因当事人一方的行为或者其他原因，使判决难以执行或者造成当事人其他损害的案件，根据对方当事人的申请，可以裁定对其财产进行保全、责令其作出一定行为或者禁止其作出一定行为；当事人没有提出申请的，人民法院在必要时也可以裁定采取保全措施。农村自建房作为不动产，属于财产范畴，在符合上述法律规定的情形下，可以成为财产保全的对象。
产权明晰角度： 申请财产保全的前提是保全的财产权属明确。农村自建房若已取得合法的宅基地使用权证和房屋所有权证（或不动产权证书），产权清晰无争议，那么在涉及相关诉讼案件时，当事人可以向法院申请对该自建房进行财产保全。若自建房产权存在争议，如存在多个权利人主张权利、未取得合法产权证明等情况，法院可能会因产权不明晰而不予批准保全申请。
保全必要性角度： 法院在决定是否采取财产保全措施时，会考虑保全的必要性。如果存在一方当事人的行为或者其他原因，可能导致判决难以执行或者造成另一方当事人其他损害的情况，如债务人有转移、隐匿、变卖农村自建房等可能损害债权人利益的行为，此时债权人申请对该自建房进行财产保全，法院通常会认为具有必要性而予以批准。
申请程序角度： 当事人申请农村自建房财产保全，需向有管辖权的人民法院提出书面申请，并提供相关证据材料，如证明债务关系存在的证据、证明被申请人有转移财产可能性的证据等，同时按照法院要求提供相应的担保。法院在收到申请后，会进行审查，符合条件的会作出保全裁定并采取相应的保全措施。