结论：组长签征地协议是否合法，需根据具体情况判断，包括是否获得合法授权、协议内容是否合法合规以及是否符合法定程序等。以下从多个角度进行分析：
一、组长签协议的合法性基础
授权情况：
- 合法授权：如果组长在签订征地协议前，已经通过村民会议或村民代表会议等合法程序，获得了村民或村民代表的明确授权，那么组长签订征地协议的行为是合法的。这种授权应当明确、具体，且符合相关法律法规的规定。
- 无授权或越权：如果组长未经合法授权或超越了授权范围签订征地协议，那么该行为可能构成无权代理或越权代理，协议的效力可能会受到质疑。
协议内容合法性：
- 内容合规：征地协议的内容必须符合法律法规的规定，包括但不限于征地目的、征地范围、补偿标准、安置方式等。如果协议内容存在违法违规之处，那么该协议可能无效或部分无效。
- 公平合理：协议内容应当公平合理，充分保障被征地农民的合法权益。如果协议内容显失公平或存在欺诈、胁迫等情形，那么被征地农民有权请求法院或仲裁机构变更或撤销该协议。
法定程序：
- 程序合规：征地协议的签订必须遵循法定的程序，包括但不限于发布征地公告、进行征地补偿登记、组织听证会等。如果程序存在瑕疵或违规，那么可能会影响协议的效力。
二、个人领取征地补偿款与组长签协议的关系
- 个人领取补偿款：个人领取征地补偿款是征地补偿过程中的一个环节，它表明个人已经接受了征地补偿的安排。然而，这并不直接决定组长签订征地协议的合法性。
- 协议签订与补偿款领取的顺序：在实际情况中，通常是在征地协议签订后，再根据协议内容向被征地农民发放补偿款。如果个人在组长签订协议前已经领取了补偿款，这可能引发对协议签订程序合法性的质疑，但并不直接决定协议的效力。关键在于协议签订时是否遵循了法定程序，并获得了合法授权。
三、法律建议
- 审查授权文件：如果对组长签订征地协议的合法性有疑问，首先应当审查组长是否获得了合法授权，以及授权的范围和期限等。
- 核对协议内容：仔细核对征地协议的内容，确保其符合法律法规的规定，并充分保障了自己的合法权益。
- 咨询专业律师：如果对协议内容或签订程序存在疑问，或者认为自己的合法权益受到了侵害，建议及时咨询专业律师，以便获得更具体的法律建议和帮助。
后续行动建议：如果您对组长签订的征地协议存在疑问或担忧，建议您先收集相关证据材料，如授权文件、协议文本等，然后向我咨询，以便我能够根据您的具体情况提供更准确的法律建议。