行政事业单位投资设立的有限公司分红处理，需结合公司性质、投资目的及法律法规综合判断，核心结论如下：

1. 分红资金归属：原则上归国家所有，需上缴财政
   根据《预算法》及《行政单位财务规则》，行政事业单位（如机关法人、事业单位）属于非营利性主体，其投资设立的有限公司若为国有独资或控股企业，分红属于国有资本收益。根据《企业国有资本收益收取管理办法》，此类分红应由企业按规定上缴财政，纳入国有资本经营预算管理，用于补充社会保障资金、支持国有企业改革发展等公共用途。
   例外情形：若行政事业单位以非财政资金投资（如自有资金、合法合规的捐赠收入），且投资协议或公司章程明确约定分红归属单位自身，可暂不上缴财政，但需符合《行政单位财务规则》中“收支两条线”管理要求，即收入需纳入单位预算统一管理，不得私设“小金库”。

2. 分红决策程序：需履行内部审批与外部备案

   • 内部程序：行政事业单位作为股东，需通过股东会或董事会审议分红方案，并留存会议记录、表决文件等材料。若单位为国有独资公司，还需根据《公司法》第66条，由国有资产监督管理机构或政府授权部门决定分红事项。
     
   • 外部程序：分红方案需报同级财政部门备案（如涉及国有资本收益上缴），部分地区可能要求同步报送国资监管部门。若分红涉及重大资产处置或金额超过单位年度预算一定比例，还需按《重大行政决策程序暂行条例》履行公众参与、风险评估等程序。

3. 税务处理：依法缴纳企业所得税与个人所得税

   • 企业层面：有限公司作为纳税主体，需按《企业所得税法》第26条，将分红收入计入应纳税所得额（若符合免税条件，如居民企业间股息红利免税，可免征企业所得税）。
     
   • 个人层面：若分红分配给行政事业单位的职工（如通过员工持股平台间接持股），需按《个人所得税法》第3条，按“利息、股息、红利所得”缴纳20%个人所得税，由单位代扣代缴。

4. 合规风险警示：需避免“账外分红”与“利益输送”
   行政事业单位不得通过虚构交易、转移利润等方式规避分红上缴义务，否则可能涉嫌违反《财政违法行为处罚处分条例》第6条，面临警告、没收违法所得、罚款等处罚；若分红流向关联方或特定个人，可能构成“利益输送”，触犯《刑法》第169条之一（背信损害上市公司利益罪，虽针对上市公司，但类似逻辑可延伸至国有控股企业）或《刑法》第385条（受贿罪）。

建议操作步骤：

1. 核查公司章程与投资协议，明确分红归属条款；
   
2. 召开股东会审议分红方案，留存完整决策文件；
   
3. 区分资金性质（财政资金/非财政资金），按要求上缴或纳入单位预算；
   
4. 依法完成企业所得税与个人所得税申报；
   
5. 定期接受财政、审计部门监督检查，确保程序合规。
   

如有具体案例或地区政策差异，可进一步向我咨询，我会结合细节提供针对性方案。