在城市更新失败转为城中村改造的情况下，物业权利人与原开发商厘清合同关系，核心在于依据原合同条款、实际履行情况及法律规定，通过协商、诉讼或仲裁等途径明确双方权利义务，解除或变更原合同，并重新确立与新改造主体的法律关系。以下从不同角度展开分析：

1. 合同解除与变更的法律依据
   根据《民法典》第五百三十三条，若原城市更新合同因政策调整（如更新失败转为城中村改造）导致合同目的无法实现，物业权利人可与原开发商协商解除合同；若部分条款仍可履行，可协商变更合同内容（如调整补偿标准、交付时间等）。若协商不成，可依据第五百六十三条主张法定解除权，但需证明“不可抗力”或“情势变更”等法定情形，并履行通知义务。

2. 原合同权利义务的清算

   • 已履行部分：双方需对原合同中已履行的义务（如已支付的补偿款、已交付的物业等）进行清算，明确无争议部分，避免后续纠纷。
     
   • 未履行部分：若原合同未履行完毕（如开发商未完成拆迁补偿），物业权利人可要求开发商继续履行或赔偿损失；若因政策变化导致无法履行，可协商折价补偿或转为其他形式的权益（如股权、长期收益权等）。

3. 与新改造主体的法律关系衔接
   城中村改造通常由政府主导或指定新主体实施，物业权利人需与新主体重新签订补偿协议或合作协议。此时需注意：

   • 原合同与新协议的衔接：明确原合同解除后，新协议是否继承原合同权利义务（如补偿标准、过渡期安排等），避免重复主张或遗漏。
     
   • 新主体的资质与承诺：核查新主体的改造权限、资金实力及政策支持，确保其具备履行能力，并在协议中约定违约责任（如逾期交付、补偿不足等）。

4. 争议解决途径

   • 协商优先：建议物业权利人与原开发商、新主体通过协商解决争议，降低时间成本。
     
   • 诉讼/仲裁：若协商无果，可依据原合同中的争议解决条款（如仲裁条款）或法定管辖（如合同履行地法院）提起诉讼或仲裁，主张解除合同、赔偿损失或确认新协议效力。

建议行动步骤：

1. 梳理原合同条款，明确双方权利义务及履行情况；
   
2. 收集政策文件（如更新转改造的政府批复），证明合同变更的合法性；
   
3. 与原开发商、新主体协商，形成书面协议（如解除协议、补充协议）；
   
4. 若协商困难，及时委托律师介入，通过法律途径维护权益。
   

如有具体合同文本或政策文件，可进一步向我提供，我将结合细节为您分析风险点及应对策略。