农村自建房承包合同属于何种性质的合同，这主要取决于自建房的层数以及具体的施工内容。

一般来说，农村自建两层（含两层）以下的低层住宅，其承包合同通常被认定为承揽合同。在这种情况下，建房施工队按照房主的具体要求完成建房工作，交付房屋，并从房主那里获得报酬。这种合同关系相对简单，更注重于完成特定的工作成果，并支付相应的报酬。

而对于农村自建三层（含三层）以上的房屋，其承包合同则更倾向于被认定为建设工程施工合同。这是因为这类房屋的建设活动已经涉及到了较为复杂的土木工程和建筑工程，需要满足建设工程合同的特殊性和安全性要求。这类合同受《中华人民共和国建筑法》等法律法规的调整，对施工单位的资质、工程的质量和安全等方面都有较为严格的规定。

需要注意的是，在实际操作中，对于农村自建房承包合同的性质认定可能会因地区、案件具体情况等因素而有所不同。因此，在签订合同时，双方应当明确合同的性质、权利义务、违约责任等内容，并在必要时咨询专业的法律人士，以确保合同的合法性和有效性。

此外，无论是承揽合同还是建设工程施工合同，双方当事人都应当遵守诚实信用原则，按照合同约定全面履行自己的义务，确保工程的顺利进行和交付。