针对医院使用特殊级抗菌药物未进行会诊的情况，其处罚主要依据相关法律法规和医疗规范进行，具体如下：

1. 行政处罚依据及内容：

   • 根据《抗菌药物临床应用管理办法》的相关规定，医疗机构若违反规定，未按照规定对特殊使用级抗菌药物会诊申请进行审核，或者未按照规定对本机构抗菌药物临床应用情况进行调查的，县级以上卫生行政部门有权责令限期改正，并给予警告。若逾期不改，可处以三万元以下罚款。对于情节严重的，还可能面临更严厉的处罚，包括停业整顿直至吊销《医疗机构执业许可证》。
   • 具体到特殊级抗菌药物的使用，若医院未进行会诊而擅自使用，这明显违反了抗菌药物临床应用的管理规定，因此，医院可能会受到上述行政处罚。

2. 可能的法律后果及责任：

   • 除了行政处罚外，医院还可能因未按规定使用特殊级抗菌药物而承担民事责任。如果因未进行会诊而导致患者受到损害，医院可能需要根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，对患者进行赔偿。赔偿范围包括但不限于医疗费、护理费、交通费、营养费、住院伙食补助费等为治疗和康复支出的合理费用，以及因误工减少的收入。造成残疾的，还应当赔偿辅助器具费和残疾赔偿金；造成死亡的，还应当赔偿丧葬费和死亡赔偿金。
   • 在极端情况下，如果医院的行为构成犯罪，如因未进行会诊而导致患者死亡或严重健康损害，相关责任人员还可能面临刑事责任的追究。

3. 实际操作中的考量因素：

   • 在实际操作中，卫生行政部门在决定处罚力度时，会综合考虑多种因素，包括医院的违规情节、是否造成严重后果、医院的态度和整改措施等。因此，即使医院存在未进行会诊而使用特殊级抗菌药物的行为，其最终受到的处罚也可能因具体情况而有所不同。
   • 同时，医院在面对此类情况时，应积极配合卫生行政部门的调查，主动采取措施进行整改，以减轻可能的处罚。

总结与建议： 医院在使用特殊级抗菌药物时，必须严格遵守相关法律法规和医疗规范，确保进行必要的会诊和审批程序。若因未进行会诊而受到处罚，医院应积极应对，配合调查，并采取措施进行整改。若您作为患者或家属，认为医院在使用特殊级抗菌药物过程中存在违规行为，并导致了您的损害，您可以依法向卫生行政部门投诉或向法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。